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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003295`

染色体: Chr05 坐标: 43111198-43119348 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003295`
名称	SmilChr05G003295
描述	uncharacterized SmilChr05G003295
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43111198 - 43119348 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024649`
GeneID	`131024649`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024649`
原始查询	`LOC131024649`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0639700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0639700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0639700` - identity=28.7; qcov=0.616; evalue=2.7e-07; confidence=low
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024649

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810139.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810139.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810139.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810139.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810139.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43118278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr5:43118287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr5:43118289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B47,C15,C35,C56
`Chr5:43118318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr5:43118344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr5:43118486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B24,D2
`Chr5:43118624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr5:43118625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr5:43118631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr5:43118658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr5:43118660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A13,A18,A21,A4,A6,A7,B10,B103,B106,B112,B140,B16,B20,B33,B40,B42,B43,B46,B49,B5,B55,B56,B78,B79,B82,B90,B92,B96,C19,C20,C21,C22,C23,C31,C40,C49,C58,C61,C64,C66,C77,C78,D2,D5,D8,D9
`Chr5:43118672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B140,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810139.1

164 aa

164

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 26-133 aa

XP_057810140.1

164 aa

164

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 26-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810139.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	26	133	2.6e-10	41.2	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057810140.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	26	133	2.6e-10	41.2	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954156.1
GTCCTCAACAAAAAACAATTTTCAATCTCCATCTCCGCGAACCCTAGTCTGAAACTCTATTTCCGCCTCATTTCATCCTCCTCCATTGTGACCACCGCCGCAAGTTAGCATCTCATGTCATCTCCATCTCCGCCGCATTTTAATCTCCGACCATCTCCATTTCCGCATTTGAATCTCCGCCAGATTTAACGCCTCCAACGGCGCGATTTCAACCACCGCCTTTTGACGAAGACTCTGTAGCAGCATTCACGGCCGAAGCT...

XM_057954157.1
CACAACTGATTTCATATAAATCCAGGTCATTCATCAACCTAAATTCAACCCACATTTCCAATCATATGCACTATTGAAGTAAGTTCCCAAATTATTGTTGCATACTTGTTTCTTGAGATGCTCGTTTCTGATAACTTGTAAGCTCCTGTTAGTGCACTATACTTGTTGGTCATGAATTTGTAATTAAAACATTGTTGCAATTTTCAGTTTCGAATATTGTTGGTAAATGATGATATGTTTGTGATGGTTTTTTGTGAATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024649
ATGGATAAGACATTTGGTATATCACATGGATCTACTCGTGATGATCGGGCGCGCAAGTTAGCAGATAGATTACTTGATGCAACTCAAAATCAACTTGTATTGGTGCCTTGCAACGTTGATAAACATTGGATTTTGACAGTCATTCAACCTTTCAAAGATCGTGTCTATTTGATGGATCCGCTTTATCATCGAAATCGAGATGCAACATGGAAATCTGTGGTCGACACCGCAATGACCATTTTCAATGCAAATAAAGACAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810139.1
MDKTFGISHGSTRDDRARKLADRLLDATQNQLVLVPCNVDKHWILTVIQPFKDRVYLMDPLYHRNRDATWKSVVDTAMTIFNANKDKRQFKKAPSWEIVKGPVQPDSKLCGFYVMRFMKEIVKAFESDDSISLTKLFHKSEYSQCEIDEVREDWASCVIHEIDK

XP_057810140.1
MDKTFGISHGSTRDDRARKLADRLLDATQNQLVLVPCNVDKHWILTVIQPFKDRVYLMDPLYHRNRDATWKSVVDTAMTIFNANKDKRQFKKAPSWEIVKGPVQPDSKLCGFYVMRFMKEIVKAFESDDSISLTKLFHKSEYSQCEIDEVREDWASCVIHEIDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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