当前解析结果
SmilChr01G002352| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002352 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002352 |
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 74F2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 40672158 - 40675127 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024650 |
|---|---|
| GeneID | 131024650 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024650 |
| 原始查询 | LOC131024650 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 74F2-like |
| 产物 | UDP-glycosyltransferase 74F2-like |
| Arabidopsis | AT2G43820 (UGT74F2)UDP-glucosyltransferase 74F2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818986] identity=55.3; qcov=0.983; evalue=1.37e-177; confidence=high |
| Rice | Os09g0518200 (OsSGT)- identity=48.6; qcov=0.993; evalue=4.41e-147; confidence=high |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024650 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057810143.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057810143.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057810143.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810143.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810143.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:40672337 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B95,C21,C73,C81 |
Chr1:40672475 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B4,C36,C37 |
Chr1:40672520 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr1:40672578 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr1:40672641 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,B97,C38,C73 |
Chr1:40672657 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr1:40672762 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:40674255 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr1:40674449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr1:40674456 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,C78 |
Chr1:40674462 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B127 |
Chr1:40674491 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810143.1PF00201
UDPGT 262-432 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810143.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 262 | 432 | 4.6e-21 | 75.9 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。