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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003306`

染色体: Chr05 坐标: 43322073-43323024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003306`
名称	SmilChr05G003306
描述	late embryogenesis abundant protein At1g64065-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43322073 - 43323024 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024657`
GeneID	`131024657`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024657`
原始查询	`LOC131024657`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein At1g64065-like
产物	late embryogenesis abundant protein At1g64065-like
Arabidopsis	`AT2G46150` (AT2G46150) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819222] identity=32.8; qcov=0.995; evalue=6.07e-30; confidence=low
Rice	`Os01g0736500` - identity=27.2; qcov=0.94; evalue=1.82e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024657

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810148.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810148.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810148.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810148.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43322239`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A18,A21,B112,B118,B124,B125,B131,B14,B18,B19,B21,B23,B26,B36,B56,B57,B59,B6,B66,B76,B77,B89,B96,C10,C14,C15,C16,C25,C26,C35,C37,C42,C45,C5,C52,C63,C73,C84,D6,D7
`Chr5:43322265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122
`Chr5:43322284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:43322312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B121,B24,C4
`Chr5:43322318`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B130,B136,C33
`Chr5:43322318`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B130,B136,C33
`Chr5:43322332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr5:43322339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr5:43322440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr5:43322467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:43322530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:43322546`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810148.1

184 aa

184

LEA_2

PF03168 LEA_2 70-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810148.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	70	167	2e-09	38.5	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954165.1
TGAGCCAACCATCTACTTCAACTACTTATTTCCTCTTCCTATATATACACTCCTCTTTTCTCAATTCTAGACATCCAATTTCCTACTTGAGCTTCCACCTCTCAAATACCTTCACGTCCCATTCATCAAAAAAAAAAAAAAAAACACTCTTCTTTCTCAACAAAAACATGTCAAAGGGAGAAGGAAGAAGCCGCAAGAAATGCTTAGCATACGTTGCAGCATTCTTGGTGTTCCAAACGGCTATCATATTAGTGTTTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024657
ATGTCAAAGGGAGAAGGAAGAAGCCGCAAGAAATGCTTAGCATACGTTGCAGCATTCTTGGTGTTCCAAACGGCTATCATATTAGTGTTTGCCCTCACAGTTATGAAGATCAAAAGCCCTAAGGTGAGGTTCAACGCCATGGTTGTCGAAAGCTTCAGCTCCAACAACAACACCGCAACTTCCATCAACATGAGGCTGCTCGCTCAACTCACCATCAAAAACACCAACTTTGGGCATTTCAAGTATGACAACGCCACGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810148.1
MSKGEGRSRKKCLAYVAAFLVFQTAIILVFALTVMKIKSPKVRFNAMVVESFSSNNNTATSINMRLLAQLTIKNTNFGHFKYDNATLVVFYNGVPLGEALIPRGRTKARKTQRFNINVDVSTDTLSDTNLGNDINSGILRLSSQAKLNGKVHLMKIIKKKKSGQMNCDWTVNLGNRQVENLRCN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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