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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003326`

染色体: Chr05 坐标: 43626347-43628769 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003326`
名称	SmilChr05G003326
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At2g15690, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43626347 - 43628769 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024674`
GeneID	`131024674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024674`
原始查询	`LOC131024674`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At2g15690, mitochondrial
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At2g15690%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G15690` (AT2G15690) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816062] identity=65.5; qcov=0.559; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os04g0174800` - identity=70.3; qcov=0.375; evalue=9.14e-119; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0009451 (RNA modification)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR); PF14432 (DYW_deaminase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810168.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057810168.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810168.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810168.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810168.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43626603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:43626831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B54
`Chr5:43627112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C30,C50
`Chr5:43627159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:43627202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:43627258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:43627304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B22,B36,D5
`Chr5:43627520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:43627839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D10
`Chr5:43628067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr5:43628149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A3,D11
`Chr5:43628439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810168.1

664 aa

332

664

PPR

DYW_deaminase

PF01535 PPR 362-386 aa PF01535 PPR 390-418 aa PF14432 DYW_deaminase 573-664 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810168.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	362	386	6e-15	55.1	PPR repeat
`XP_057810168.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	390	418	6e-15	55.1	PPR repeat
`XP_057810168.1`	Pfam	`PF14432`	DYW_deaminase	Domain	573	664	9.8e-43	144.6	DYW family of nucleic acid deaminases

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954185.1
GCTTCTTCATCCATTATTATCAGTTATCCCTATTATTTTTCAGTAGGGTTTATCACTCTCTCTTTCTCTCTGCAACACATCCCAACTAGGGTTTAACCCTTCCATATCCACCGTCTACAAATGGCGTCGCCGTTATCTTCCATTTTCCGAGCTCGATTCCCCTTTACCACTTCATCTATCTACAAGGTACGCCCTTCCCCCCCTTTCATTTCAATTTCCCAAACCCTAATCCGATACCCGGTGATCAGAGCTCTCTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024674
ATGGCGTCGCCGTTATCTTCCATTTTCCGAGCTCGATTCCCCTTTACCACTTCATCTATCTACAAGGTACGCCCTTCCCCCCCTTTCATTTCAATTTCCCAAACCCTAATCCGATACCCGGTGATCAGAGCTCTCTCCACCTCCGCCCTTCCCGGTGATTTCCATCTTCCAGATCCCCAGTCGCCTGCTCCTTCCTTCAATTTCAATCAGAATCCCGGCAATCAGGGCGCCCCCCGGAATAATGATTTCGGGAACCCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810168.1
MASPLSSIFRARFPFTTSSIYKVRPSPPFISISQTLIRYPVIRALSTSALPGDFHLPDPQSPAPSFNFNQNPGNQGAPRNNDFGNPTGQRNNNFQNNQGYDAGYGNSNGGVNRGYPNQGSFSPGQGVNPSPNFPEQGVRQNQRYPPNSRTNMVRDNVNQWGNNQNQGPRSYSSPNLARDNNQNQGYAPSSNPNLVRDNANQWSNNQNQGYAANPTPNLERGYPQQGGFQNQGYPQNPNRPSGVGGGGVNQGRNSYNAQPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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