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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003351`

染色体: Chr05 坐标: 44239606-44242218 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003351`
名称	SmilChr05G003351
描述	uncharacterized SmilChr05G003351
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44239606 - 44242218 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024690`
GeneID	`131024690`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024690`
原始查询	`LOC131024690`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0587F01.11; symbol=P0587F01.11; hit=Os05g0289400; species=rice; confidence=low
产物	P0587F01.11; symbol=P0587F01.11; hit=Os05g0289400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G13210` (AT3G13210) crooked neck protein, putative / cell cycle protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820511] identity=45.8; qcov=0.366; evalue=5.9e-36; confidence=low
Rice	`Os05g0289400` (P0587F01.11) - identity=45.2; qcov=0.366; evalue=1.05e-43; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024690

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810197.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810197.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810197.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810197.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44239826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,C12,D11,D4
`Chr5:44240080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:44240131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D4
`Chr5:44240147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:44240266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B37,C38
`Chr5:44240299`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B7,B80,C11,C69
`Chr5:44240299`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B7,B80,C11,C69
`Chr5:44240479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B110,C60,C62,C82
`Chr5:44240489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B21,B68,C35,C48
`Chr5:44240687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,C12,D11,D4
`Chr5:44240738`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B40
`Chr5:44240738`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810197.1

489 aa

244

489

DUF1985

PF09331 DUF1985 22-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810197.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	22	152	2.3e-16	60.7	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954214.1
ACTAACTCGTTGTTGTGCACTTAAGATAATAATTATAATCAAGGATAATCTACACGAGAGGAATCTCAAAAGATTTGTAGAAAATTCATGCTTCGGTCATCTGCTGAATATGAATCAACTCAGATTTCAAGGGCAGCTGCTGCTGCACTTGCTGTTGCACATAGACATGGCTGCCTCCAACAACACCACCCTTGTTTTCAACATTAACAACTCTAGCATGGAATTCCAACCTACAGATTTCCATCTCATCACAGGGCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024690
ATGAATCAACTCAGATTTCAAGGGCAGCTGCTGCTGCACTTGCTGTTGCACATAGACATGGCTGCCTCCAACAACACCACCCTTGTTTTCAACATTAACAACTCTAGCATGGAATTCCAACCTACAGATTTCCATCTCATCACAGGGCTTCGTTTAGTCAATTCCGAGGCATCATCATCAACAACAACATCCTCGTCTATTCACAAGCGTGTTTTCCAAGGTAGGCCGACTATCATGTTCAAGGACGTTGAAGAAGCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810197.1
MNQLRFQGQLLLHLLLHIDMAASNNTTLVFNINNSSMEFQPTDFHLITGLRLVNSEASSSTTTSSSIHKRVFQGRPTIMFKDVEEAFLDVSHDHEGRGEVTLKLALLYFLYGVVLPASPTKKIDLHYLHLADNLEAFNAFPWGQVAHELLVSSMLSARLCMDSSRATRLVMHGFIFALQVWAYEKLPSVATHCAAPAHNLQHSTVQILRWSATKIIRFQHLKPFFTLGDEVLQSAQASPEQQNAKVEPSTWTDSSASTIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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