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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003352`

染色体: Chr05 坐标: 44243828-44244963 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003352`
名称	SmilChr05G003352
描述	pre-mRNA-splicing factor clf1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44243828 - 44244963 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024691`
GeneID	`131024691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024691`
原始查询	`LOC131024691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-splicing factor clf1-like
产物	pre-mRNA-splicing factor clf1-like
Arabidopsis	`AT5G41770` (AT5G41770) crooked neck protein, putative / cell cycle protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834182] identity=50.7; qcov=0.904; evalue=2.29e-41; confidence=medium
Rice	`Os05g0289400` (P0587F01.11) - identity=46.9; qcov=0.964; evalue=5.92e-38; confidence=medium
GO	GO:0000245 (spliceosomal complex assembly); GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0000974 (Prp19 complex); GO:0005515 (protein binding); GO:0071007 (U2-type catalytic step 2 spliceosome); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071014 (post-mRNA release spliceosomal complex)
KEGG	-
Pfam	PF23241 (HAT_PRP39_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810198.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810198.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810198.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810198.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810198.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44243981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:44244024`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	D11,D4
`Chr5:44244024`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	D11,D4
`Chr5:44244100`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A20,A3,B54,B87,C69,D9
`Chr5:44244185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B110,B98
`Chr5:44244326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B55,C46
`Chr5:44244666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C76
`Chr5:44244736`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	152	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A19,A2,A21,A23,A6,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B108,B109,B111,B112,B113,B117,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B129,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B17,B19,B2,B21,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B30,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B5,B54,B57,B58,B59,B61,B64,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B97,B99,C10,C11,C15,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C24,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C36,C4,C40,C41,C42,C46,C47,C48,C50,C52,C53,C54,C55,C58,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C75,C77,C78,C79,C8,C84,C86,C87,C9,D2,D3,D4,D5,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810198.1

166 aa

166

HAT_PRP39_C

PF23241 HAT_PRP39_C 51-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810198.1`	Pfam	`PF23241`	HAT_PRP39_C	Repeat	51	141	5.2e-08	33.8	PRP39 C-terminal HAT repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954215.1
GTCATTGCCTACCTACAATATGAACATGTGATTCATAGAGTTAACATGTTTCTCCTGCTATTCTTGCAGGTAGAGGGACGATCACAAGCTGAGGATGTCGTGGAATCGTTACTAAAAAATTCTGATCAGCCAATTCCGGATACTAGCATGATGACCTTCCCAGAAATGAATCTCCTGAGGTAGAAGACAAAGAGGCCATGAAGAAGCCAACTCTGACTAGGCATAGGACATTTGATCCTAATCCCGTCTCCACGAACAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024691
ATGAAGAAGCCAACTCTGACTAGGCATAGGACATTTGATCCTAATCCCGTCTCCACGAACAAGTTGCAGAGCTCCTTGGCAGAAACTGAACGAACCAGAGCTCTCTTTGCTCTTGCATTTGACAGCCCTGCTCTAGATATGCCACATCTATTATGGAAGACATATAGCGAGTTTGAAATATCTGAAGCTGAATATGAAAGAAGTAAAGCGCTTTATGAGATGCTTCTGGAGCGAACAAAACGGTTGAAGTTGTGGATCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810198.1
MKKPTLTRHRTFDPNPVSTNKLQSSLAETERTRALFALAFDSPALDMPHLLWKTYSEFEISEAEYERSKALYEMLLERTKRLKLWISYAQFEAFAMIKVVDLADKRKCVERARDVFERGLSYFRSCGPEMKEERATLLEEWLEMENRFGDVELVRGKLAPKLKKRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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