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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002356`

染色体: Chr01 坐标: 40740704-40743166 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002356`
名称	SmilChr01G002356
描述	transmembrane ascorbate ferrireductase 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40740704 - 40743166 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024699`
GeneID	`131024699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024699`
原始查询	`LOC131024699`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane ascorbate ferrireductase 2-like
产物	transmembrane ascorbate ferrireductase 2-like
Arabidopsis	`AT5G38630` (CYB-1) cytochrome B561-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833853] identity=40.9; qcov=0.9; evalue=8.23e-58; confidence=medium
Rice	`Os08g0384000` - identity=40.5; qcov=0.823; evalue=4.76e-50; confidence=medium
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03188 (Cytochrom_B561)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057810220.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057810227.1`
3	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057810227.1`
4	Endosome	内体	0.40000	`XP_057810220.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057810220.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40740864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B125,B90,B92
`Chr1:40740901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:40742235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C11,C69
`Chr1:40742259`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B4,C36,C37,C61
`Chr1:40742259`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B4,C36,C37,C61
`Chr1:40742922`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B128,B82,C34,C75,D9
`Chr1:40742922`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B128,B82,C34,C75,D9
`Chr1:40742996`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A18,B100,B109,B119,B13,B131,B138,B139,B17,B34,B44,B55,B58,B6,B64,B81,B9,C10,C20,C6,C74,C81,C82,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810220.1

237 aa

118

237

Cytochrom_B561

PF03188 Cytochrom_B561 62-200 aa

XP_057810227.1

231 aa

116

231

Cytochrom_B561

PF03188 Cytochrom_B561 62-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810220.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	62	200	7.2e-37	127.4	Eukaryotic cytochrome b561
`XP_057810227.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	62	194	3.8e-41	141.3	Eukaryotic cytochrome b561

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954244.1
CATCAATATTCCCACAAAAGGAAATTACAAAACCTCTTTCTTCACACATCAAATTTTATAGGAACAAGAAAAATACACGGAAGACTCCAAAAACTTCTTGTTCTCGTAGCCAACACACAAACACTAACTTAATTATATATATGTGTATGAATATATGCATATATGTGATATATATATATGCAGCATGGCCACGAACCGATATTCCAGCCACCAAGCTGCGGCGGCCATGTTGGCTCATTTGGTGGCGGCGGCGCTCATCA...

XM_057954237.1
AAAACCTCTTTCTTCACACATCAAATTTTATAGGAACAAGAAAAATACACGGAAGACTCCAAAAACTTCTTGTTCTCGTAGCCAACACACAAACACTAACTTAATTATATATATGTGTATGAATATATGCATATATGTGATATATATATATGCAGCATGGCCACGAACCGATATTCCAGCCACCAAGCTGCGGCGGCCATGTTGGCTCATTTGGTGGCGGCGGCGCTCATCACTTTGGTACTGGTTTGGCTGCTTCATTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024699
ATGCATATATGTGATATATATATATGCAGCATGGCCACGAACCGATATTCCAGCCACCAAGCTGCGGCGGCCATGTTGGCTCATTTGGTGGCGGCGGCGCTCATCACTTTGGTACTGGTTTGGCTGCTTCATTTCCGCGGTGGCCTTGCCTTCAAATCAGATAATAAAGCCAAGATTTTCAATCTGCACCCACTGCTAATGATTATTGGTTTCGTCTTGTTCTCCGGAGAAGCGATGATGGCGTACAAGACAGTTCCGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810220.1
MHICDIYICSMATNRYSSHQAAAAMLAHLVAAALITLVLVWLLHFRGGLAFKSDNKAKIFNLHPLLMIIGFVLFSGEVIFVCIAMMAYKTVPANRKRQKVFHLVVHLIALLAGILGVYAVFDYHKQSKIIHLYTLHSWLGITTISLFAFQWVVSLLTFWYPGAQESAKGRLSRWHVVVGVPIFAMMILSAETGVVEKFIFLGLRRNQEALILNLIGLFIFIFALSVALTLALPRYNS

XP_057810227.1
MHICDIYICSMATNRYSSHQAAAAMLAHLVAAALITLVLVWLLHFRGGLAFKSDNKAKIFNLHPLLMIIGFVLFSGEAMMAYKTVPANRKRQKVFHLVVHLIALLAGILGVYAVFDYHKQSKIIHLYTLHSWLGITTISLFAFQWVVSLLTFWYPGAQESAKGRLSRWHVVVGVPIFAMMILSAETGVVEKFIFLGLRRNQEALILNLIGLFIFIFALSVALTLALPRYNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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