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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002412`

染色体: Chr05 坐标: 26622651-26628809 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002412`
名称	SmilChr05G002412
描述	squamosa promoter-binding-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26622651 - 26628809 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024703`
GeneID	`131024703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024703`
原始查询	`LOC131024703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squamosa promoter-binding-like protein 1
产物	squamosa promoter-binding-like protein 1
Arabidopsis	`AT3G60030` (SPL12) squamosa promoter-binding protein-like 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825173] identity=50.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0833300` (SPL6) - identity=41.5; qcov=1.05; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03110 (SBP); PF26102 (Ig_SPL7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057810223.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810223.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057810223.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810223.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810223.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26622974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr5:26623054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:26623075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:26623481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr5:26623784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr5:26623882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr5:26624078`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B44
`Chr5:26624078`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B44
`Chr5:26624081`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B97
`Chr5:26624081`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B97
`Chr5:26624361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B68,C48,C75
`Chr5:26625544`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810223.1

943 aa

472

943

SBP

Ig_SPL7

PF03110 SBP 120-193 aa PF26102 Ig_SPL7 525-636 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810223.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	120	193	9.1e-30	103.5	SBP domain
`XP_057810223.1`	Pfam	`PF26102`	Ig_SPL7	Domain	525	636	2.7e-40	137.7	SPL7-like, immunoglobulin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954240.1
AGAGAGAGAGAGAGAGAGCTGCGGGTGTGGGTCTTAGATTCTGTGAAGTGGGTGTCCTCACTAATACACCACTTGTTCATCTGTACTATGTTTTCGTTTCTTTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTCTCTTTTTCTTCTTTCCTGAGAATACTATGTTGTGAATTTTTACACGACAAGGCAATTACAAGAAAAATAATGCAGGGTGAAATAATTTTACAAGCAAAGCAACAGACGCAGTGAATTAAGTCCCATTTTTCTTTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024703
ATGGAGACCAAGTTTGGTGGAAAGTTGCATAATTTCTATGGGCCGGTGGTGTCTGAGGTGGGGAAGAAGAGCACGGAATGGGATTTGAATGATTGGAAATGGGATGGTGATCTTTTTATGGCTTCTCCCTTGAATCCTGCGCCTACAGATTGTACAAGTAGGCAGCCCTTTAACAATGATGAAATGATGATCCAGAATGAGAGGGAGAAAAGGAGAAGGGTTGTTGAGGTTGAAAATGAAGAAGCTGGTGGCTCACTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810223.1
METKFGGKLHNFYGPVVSEVGKKSTEWDLNDWKWDGDLFMASPLNPAPTDCTSRQPFNNDEMMIQNEREKRRRVVEVENEEAGGSLNLKLGHQEYPLDESEGKSGKKTKVSGIPSSRAVCQVEDCKADLSTAKDYHRRHKVCDVHSKATSALVANVVQRFCQQCSRFHVLQEFDEGKRSCRRRLAGHNRRRRKTHPENVLNAANQNDERGSNYLLISLLRILSNLQFNSSDQTKDQDLLSHLLKNLASVASTTNERNHTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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