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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002405`

染色体: Chr05 坐标: 26561307-26562324 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002405`
名称	SmilChr05G002405
描述	1-Cys peroxiredoxin
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26561307 - 26562324 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024707`
GeneID	`131024707`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024707`
原始查询	`LOC131024707`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-Cys peroxiredoxin
产物	1-Cys peroxiredoxin
Arabidopsis	`AT1G48130` (PER1) 1-cysteine peroxiredoxin 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841231] identity=67.4; qcov=1; evalue=9.88e-107; confidence=high
Rice	`Os07g0638300` (Os1-CysPrxA) - identity=71.2; qcov=0.995; evalue=4.63e-118; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005829 (cytosol); GO:0045454 (cell redox homeostasis); GO:0051920 (peroxiredoxin activity); GO:0098869 (cellular oxidant detoxification)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin); PF10417 (1-cysPrx_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024707

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810230.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810230.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810230.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810230.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810230.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26561351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:26561356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr5:26561423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B31,B50,C42
`Chr5:26561694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B95,C10,C63,C73
`Chr5:26561940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:26562023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B33,B68,C48,C75
`Chr5:26562067`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr5:26562067`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr5:26562125`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B30,B66,B72,B90,B92,C21,C25,C41,C70,C83,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810230.1

220 aa

110

220

AhpC-TSA

Redoxin

1-cysPrx_C

PF00578 AhpC-TSA 6-140 aa PF08534 Redoxin 7-152 aa PF10417 1-cysPrx_C 163-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810230.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	6	140	4.2e-29	101.7	AhpC/TSA family
`XP_057810230.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	7	152	3.7e-12	47.0	Redoxin
`XP_057810230.1`	Pfam	`PF10417`	1-cysPrx_C	Domain	163	200	6.3e-10	39.6	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954247.1
CCGGATACCAACGTAATTAATCCTTAATTAGAAAGATGCCTGGGCTTACCATCGGCGACCCCCTCCCCAATCTCGAAGTGGAAACCACCCATGGCCCCATCAAACTCCACGACTACGTCGCCGACTCTTTCACCATCATCTTCTCTCATCCAGGCGACTTCACTCCCGTGTGCACGACGGAGCTCGGAGCGATGGCCGCCTATGCCGACAAATTCTCAAAGCTCGGCGTGAAGCTGCTGGGGCTCTCTGCCGATGACGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024707
ATGCCTGGGCTTACCATCGGCGACCCCCTCCCCAATCTCGAAGTGGAAACCACCCATGGCCCCATCAAACTCCACGACTACGTCGCCGACTCTTTCACCATCATCTTCTCTCATCCAGGCGACTTCACTCCCGTGTGCACGACGGAGCTCGGAGCGATGGCCGCCTATGCCGACAAATTCTCAAAGCTCGGCGTGAAGCTGCTGGGGCTCTCTGCCGATGACGTCGAGTCCCATAACGCTTGGATCAAGGACATCGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810230.1
MPGLTIGDPLPNLEVETTHGPIKLHDYVADSFTIIFSHPGDFTPVCTTELGAMAAYADKFSKLGVKLLGLSADDVESHNAWIKDIEAYCNGCKVTYPIAADPHRKIIKELNMVDPDEKDSSGNQVPSRALHIIGPDKRVKLSFLYPASTGRNMDEVVRVVESLQRAAKHKIATPANWKAGDAVVISPGVSTEQAKEMFPQGYKTAHLPSNKPYLRFTNVD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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