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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000056`

染色体: Chr05 坐标: 266123-267396 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000056`
名称	SmilChr05G000056
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	266123 - 267396 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024718`
GeneID	`131024718`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024718`
原始查询	`LOC131024718`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=35.1; qcov=0.513; evalue=1.21e-23; confidence=medium
Rice	`Os02g0301800` (P0477B05.2-1) - identity=26.6; qcov=0.85; evalue=3.54e-24; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024718

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057810239.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810239.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810239.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810239.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:266125`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B83,C59
`Chr5:266125`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr5:266126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:266181`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B88,C29,C87
`Chr5:266181`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B88,C29,C87
`Chr5:266226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B68,C16
`Chr5:266232`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A11,B122,B18,B32,B44,B48,B49,B6,B62,B63,B67,B73,B79,B8,B81,B82,C10,C39,C41,C45,C67,C7,C8
`Chr5:266235`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A11,B122,B18,B32,B44,B48,B49,B6,B62,B63,B67,B73,B79,B8,B81,B82,C10,C39,C41,C45,C67,C7,C8
`Chr5:266254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B91,C20,C32,C68
`Chr5:266284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr5:266293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr5:266298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810239.1

394 aa

197

394

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 175-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810239.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	175	325	2.9e-26	92.8	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954256.1
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCGACTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCCTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACTAATCTTACTACCTGCCTACCTCGAGATGAATCACTTGCAGAGAATTCTGCTATTATTGGACGAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTTTGGATGAACTCATAAAAGAGGCAGTCTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATGTCTTACATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024718
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCGACTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCCTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACTAATCTTACTACCTGCCTACCTCGAGATGAATCACTTGCAGAGAATTCTGCTATTATTGGACGAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTTTGGATGAACTCATAAAAGAGGCAGTCTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATGTCTTACATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810239.1
MAAYGAATSLKNTIQRILQSSRISLVSHSPLILLPAYLEMNHLQRILLLLDETSCSKIRTKVNALDELIKEAVWEFEDLLESHVLHQILPQLESERDNLSFSVDLQSLQHRVDCFVQMVKMMEEEYFIEMGNMAEEEGEPISSRIDFGGIKSKMVGLSHEFQEATDVLLEGKDYSIIGMAGIGKTTLAKHIFEDPSIRGQFEFRAWVRVGRKCEPNELLRCILAQVDPNAYQMLTQGDDDDEEELDGLLKEKLKHKKCLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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