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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000092`

染色体: Chr05 坐标: 521443-522116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000092`
名称	SmilChr05G000092
描述	agglutinin-2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	521443 - 522116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024725`
GeneID	`131024725`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024725`
原始查询	`LOC131024725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agglutinin-2-like
产物	agglutinin-2-like
Arabidopsis	`AT5G10530` (AT5G10530) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830918] identity=28.9; qcov=1.07; evalue=2.28e-07; confidence=low
Rice	`Os09g0334800` - identity=29.9; qcov=1.03; evalue=3.51e-10; confidence=low
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00139 (Lectin_legB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024725

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057810246.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810246.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057810246.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810246.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810246.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:521622`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A1,A24,A7,B10,B108,B13,B134,B4,B41,B49,B50,B56,B60,B7,B77,B96,B98,C20
`Chr5:521630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B72
`Chr5:521720`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A14,A21,B101,B132,B136,B17,B32,B57,B61,B62,B63,B7,B71,B79,C1,C19,C38,C62
`Chr5:521735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B60,B91,C55
`Chr5:521797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B113,B95
`Chr5:521797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B95
`Chr5:521896`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	68	A11,A6,A7,A8,B1,B105,B11,B111,B113,B118,B119,B122,B126,B128,B137,B23,B26,B3,B33,B34,B4,B45,B47,B5,B52,B55,B68,B73,B74,B76,B81,B83,B85,B86,B94,B95,B97,B99,C14,C19,C21,C23,C24,C26,C28,C29,C32,C39,C42,C43,C44,C51,C56,C59,C68,C72,C73,C76,C79,C8,C82,C86,C87,C9,D10,D11,D4,D5
`Chr5:521913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	B10,B103,B125,B13,B134,B14,B31,B4,B42,B43,B50,B6,B60,B77,B90,B92,C17,C25,C35,C44,C67,C87
`Chr5:521976`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A14,A21,A9,B101,B115,B12,B124,B129,B132,B136,B18,B2,B32,B40,B51,B61,B62,B71,B75,C1,C17,C31,C37,C38,C45,C62,D6
`Chr5:522012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	66	A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A9,B106,B119,B12,B123,B124,B13,B138,B139,B140,B17,B18,B19,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B35,B36,B38,B39,B48,B49,B51,B63,B65,B84,B85,B87,B93,B98,C12,C15,C2,C22,C30,C32,C34,C4,C41,C43,C46,C48,C49,C5,C50,C53,C56,C61,C68,C75,C77,C81,D2
`Chr5:522031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr5:522047`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810246.1

142 aa

142

Lectin_legB

PF00139 Lectin_legB 8-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810246.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	8	133	6.4e-17	62.6	Legume lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954263.1
TCCCCGCCGGTTCCACTGGCGGAAAACCTCGGAATCTTCAACTCGGGCACCAGCCCCTCCTCCGTCTTTGTCGTTGAGTTCGATCCATACGCCAACGATCATTGGGATCCAAATTTCCGCCATGTTGGGATTGATCTCGGATCTAGGGTTTCCAGCAATACGACGGAGGTCGGTGGCTCCATAACCGGGCAGCAGGTGGGTTGGCGGACAGAGAAAAAAATTCTTGATAGAGGCTGTGACTGCCCGAATCAACTACGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024725
TCCCCGCCGGTTCCACTGGCGGAAAACCTCGGAATCTTCAACTCGGGCACCAGCCCCTCCTCCGTCTTTGTCGTTGAGTTCGATCCATACGCCAACGATCATTGGGATCCAAATTTCCGCCATGTTGGGATTGATCTCGGATCTAGGGTTTCCAGCAATACGACGGAGGTCGGTGGCTCCATAACCGGGCAGCAGGTGGGTTGGCGGACAGAGAAAAAAATTCTTGATAGAGGCTGTGACTGCCCGAATCAACTACGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810246.1
SPPVPLAENLGIFNSGTSPSSVFVVEFDPYANDHWDPNFRHVGIDLGSRVSSNTTEVGGSITGQQVGWRTEKKILDRGCDCPNQLRGSHEDDHRSYHCRHEEVGLSASTGDNVATHDIVSWDFSATMVNMKKNMDVMIRQYV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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