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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000109`

染色体: Chr05 坐标: 710744-711439 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000109`
名称	SmilChr05G000109
描述	lectin-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	710744 - 711439 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024728`
GeneID	`131024728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024728`
原始查询	`LOC131024728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lectin-like
产物	lectin-like
Arabidopsis	`AT5G65600` (AT5G65600) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836686] identity=24.6; qcov=1; evalue=2.71e-08; confidence=weak
Rice	`Os09g0334800` - identity=30.6; qcov=1.05; evalue=1.73e-19; confidence=low
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00139 (Lectin_legB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057810248.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057810248.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810248.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810248.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810248.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:710748`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	164	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A22,A24,A4,A7,A8,A9,B1,B10,B102,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B139,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B23,B25,B26,B28,B30,B31,B33,B35,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B45,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B59,B61,B62,B65,B66,B7,B70,B71,B72,B73,B76,B78,B8,B80,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,C1,C10,C11,C13,C15,C18,C19,C2,C21,C22,C26,C27,C29,C3,C30,C33,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C59,C60,C62,C63,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C74,C75,C76,C8,C80,C81,C84,C85,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8
`Chr5:710750`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	164	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A22,A24,A4,A7,A8,A9,B1,B10,B102,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B139,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B23,B25,B26,B28,B30,B31,B33,B35,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B45,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B59,B61,B62,B65,B66,B7,B70,B71,B72,B73,B76,B78,B8,B80,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B92,B93,B94,B96,B97,C1,C10,C11,C13,C15,C18,C19,C2,C21,C22,C26,C27,C29,C3,C30,C33,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C59,C60,C62,C63,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C74,C75,C76,C8,C80,C81,C84,C85,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8
`Chr5:710768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B117,B122,B131
`Chr5:710787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr5:710824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:710826`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A1,A11,A24,A3,A5,A7,B112,B3,B34,B53,B73,B83,C30,C32,C54,C55,C56,C63,C68,C73,C80,C83,D1
`Chr5:710836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B67,C11,C69
`Chr5:710837`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A10,A8,B1,B101,B109,B113,B12,B121,B133,B35,B40,B52,B54,B77,B99,C11,C39,C46,C73,C8,C80,C82,C87,C9,D5
`Chr5:710854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:710857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:710862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr5:710875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A6,B57,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810248.1

231 aa

116

231

Lectin_legB

PF00139 Lectin_legB 7-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810248.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	7	229	4e-29	102.6	Legume lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954265.1
ATGGCGTCGCCACCCACCAAATTCGACTTCGACTTCTACGAGTCGAAGCCGAAGGAACTAATCTACCAAGTGGACGCCCACTTCCCCAAGGAGACCCCCTTCCTCCGCCTCACCAAAACCGACGATCACGACACTCCGCTGCAGCGGAGCACCGGCCGCGTCCTCTATTCCAAGCCCGTGGCGTTCGGGCACGGAGGGGCCAAAGCCGACTTCGAAACCACGGTGAAATTCATCGTGAGAGTGAAGGCCAAGACGCCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024728
ATGGCGTCGCCACCCACCAAATTCGACTTCGACTTCTACGAGTCGAAGCCGAAGGAACTAATCTACCAAGTGGACGCCCACTTCCCCAAGGAGACCCCCTTCCTCCGCCTCACCAAAACCGACGATCACGACACTCCGCTGCAGCGGAGCACCGGCCGCGTCCTCTATTCCAAGCCCGTGGCGTTCGGGCACGGAGGGGCCAAAGCCGACTTCGAAACCACGGTGAAATTCATCGTGAGAGTGAAGGCCAAGACGCCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810248.1
MASPPTKFDFDFYESKPKELIYQVDAHFPKETPFLRLTKTDDHDTPLQRSTGRVLYSKPVAFGHGGAKADFETTVKFIVRVKAKTPHADGLVFFIVPEGHAFPSAAMGGNLGIFEPSGKSSHVFAVAFDIYPTTPGYITLGICIESRIPKSVIQVPDSFVGKELTLGVSYVAATGLISASVSDGSETFPVSFVYNLSEILPPRVQVGLASSTGEYVVVHDVASWGFKSTIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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