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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000133`

染色体: Chr05 坐标: 1078352-1079302 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000133`
名称	SmilChr05G000133
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1078352 - 1079302 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024735`
GeneID	`131024735`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024735`
原始查询	`LOC131024735`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G59218` (AT1G59218) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842234] identity=26.6; qcov=1.01; evalue=2.58e-07; confidence=low
Rice	`Os01g0953400` - identity=24.4; qcov=0.908; evalue=5.93e-06; confidence=weak
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024735

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810257.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810257.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810257.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810257.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1078377`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr5:1078377`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr5:1078378`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A11,A20,A24,A6,B111,B112,B123,B128,B22,B24,B26,B34,B44,B68,B74,B82,B84,C2,C48,C60,C65,C70,C86
`Chr5:1078381`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A11,A20,A24,A6,B111,B112,B123,B128,B22,B24,B26,B34,B44,B68,B74,B82,B84,C2,C48,C60,C65,C70,C86
`Chr5:1078462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:1078544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B84,C84
`Chr5:1078619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D11
`Chr5:1078669`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A11,A20,A24,B111,B112,B118,B22,B26,B34,B44,B56,B68,B74,B82,B84,B96,C2,C48,C60,C65,C70
`Chr5:1078674`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A11,A20,A24,B111,B112,B118,B22,B26,B34,B44,B56,B68,B74,B82,B84,B96,C2,C48,C60,C65,C70
`Chr5:1078729`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A24,B49,B68,C11,C42,C62,C69
`Chr5:1078732`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A24,B49,B68,C11,C42,C62,C69
`Chr5:1078852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A7,B115,B121,B2,B3,C66,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810257.1

316 aa

158

316

LRR_14

PF23598 LRR_14 3-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810257.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	3	265	7.5e-14	52.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954274.1
ATGGGTTTCAAGTTGCTCAAGGTACTAGAAACTGTTAAAGTCCGGTTTTACCATATTCCAACTGAAATTTTGAAGCTACTTTATCTGCGGTTGCTTGCCCTAATTTGCAACGCGGACCTCCCTCCTTCCATATCCAACCTTTTTAACCTTCAAGTCTTGATTATCTATCCATATATGAATATTAAAAAGCGTGGAGTTCAGTCATATATGCCCGTGCAAATTTGGGACTTGGAAGAACTACAACATATTGAGATAATGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024735
ATGGGTTTCAAGTTGCTCAAGGTACTAGAAACTGTTAAAGTCCGGTTTTACCATATTCCAACTGAAATTTTGAAGCTACTTTATCTGCGGTTGCTTGCCCTAATTTGCAACGCGGACCTCCCTCCTTCCATATCCAACCTTTTTAACCTTCAAGTCTTGATTATCTATCCATATATGAATATTAAAAAGCGTGGAGTTCAGTCATATATGCCCGTGCAAATTTGGGACTTGGAAGAACTACAACATATTGAGATAATGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810257.1
MGFKLLKVLETVKVRFYHIPTEILKLLYLRLLALICNADLPPSISNLFNLQVLIIYPYMNIKKRGVQSYMPVQIWDLEELQHIEIMGTDLPTPNTYDATLNKLITLLGVSANSCTWEVLKRTPNLKRLSIHVELKPYDDDSDETNPLSCLSYISQLQNLVNLEYSIWNPEMKYELHTIPLSMFPSHLNDLRLRGLGYPWKYMNDIGSLLPNLQHLNLKSYAFRGPMWEIKPGSFLKLTTLQIKDTDLVQWRPQHGSFPEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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