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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000144`

染色体: Chr05 坐标: 1181068-1182159 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000144`
名称	SmilChr05G000144
描述	uncharacterized SmilChr05G000144
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1181068 - 1182159 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024736`
GeneID	`131024736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024736`
原始查询	`LOC131024736`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842179]; symbol=AT1G58120; hit=AT1G58120; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842179]; symbol=AT1G58120; hit=AT1G58120; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G58120` (AT1G58120) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842179] identity=35.7; qcov=1.07; evalue=1.83e-46; confidence=medium
Rice	`Os07g0620600` (P0594D10.115) - identity=32.6; qcov=0.879; evalue=6.52e-31; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25276 (DUF7870)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057810258.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057810258.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057810258.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810258.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810258.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1181143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C22,C40,C49
`Chr5:1181241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:1181272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C32,C68,C70,D9
`Chr5:1181275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C8
`Chr5:1181276`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr5:1181276`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr5:1181313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:1181370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:1181415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B52
`Chr5:1181435`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr5:1181435`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr5:1181438`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810258.1

363 aa

182

363

DUF7870

PF25276 DUF7870 219-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810258.1`	Pfam	`PF25276`	DUF7870	Domain	219	362	1.9e-47	162.4	Domain of unknown function (DUF7870)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954275.1
ATGGACAAATCGGGCCGTGGCCGCAGCGTTAAGAGCGGAGGCAGTGATGTTGATAGTGATGAGCCGGATGAGTTCGAATTAGGGCTAAATTCCGACGCCATTTTCGTCATCAAGCTCCCCGATTCGCGATCCCTGCGCGTCGTATCGAGATCCCTGTTCCTGGCGGTGGTTCTCCTCTCGTTGCCCTCGATCGGCTCGATTATCCTCGCGGCCTCCCACGCGCCGCCGCTGCCGCTGCACGACGCGGAATCGTCTGATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024736
ATGGACAAATCGGGCCGTGGCCGCAGCGTTAAGAGCGGAGGCAGTGATGTTGATAGTGATGAGCCGGATGAGTTCGAATTAGGGCTAAATTCCGACGCCATTTTCGTCATCAAGCTCCCCGATTCGCGATCCCTGCGCGTCGTATCGAGATCCCTGTTCCTGGCGGTGGTTCTCCTCTCGTTGCCCTCGATCGGCTCGATTATCCTCGCGGCCTCCCACGCGCCGCCGCTGCCGCTGCACGACGCGGAATCGTCTGATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810258.1
MDKSGRGRSVKSGGSDVDSDEPDEFELGLNSDAIFVIKLPDSRSLRVVSRSLFLAVVLLSLPSIGSIILAASHAPPLPLHDAESSDWIENLPILLHDLTAEGLLSKGDKGFVLGVSGEVDFAANWMNAHHVFDYIYAPSFSAIEEMGGGAVRDGGLAIAPLGGDISAELRLLRNFKIVYLRRLNGDTVVAMRKKSEANSGAGRVICGGGIGGEKKEAALRGLEEVYLEPPRFAKKSSFRFLPDLMEDALDGYRRRVFVAD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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