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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000145`

染色体: Chr05 坐标: 1184607-1187204 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000145`
名称	SmilChr05G000145
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1184607 - 1187204 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024737`
GeneID	`131024737`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024737`
原始查询	`LOC131024737`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=23.7; qcov=1.04; evalue=1.89e-39; confidence=weak
Rice	`Os03g0689400` - identity=26.4; qcov=0.797; evalue=7.47e-37; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024737

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057810259.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810259.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810259.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810259.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1184690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B86
`Chr5:1184701`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B1,B105,B134,B85,C52
`Chr5:1184701`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B105,B134,B85,C52
`Chr5:1184709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr5:1184759`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B108,B40,B65,C72
`Chr5:1184759`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B108,B40,B65,C72
`Chr5:1184776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,D9
`Chr5:1184780`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A15,B10,B100,B105,B115,B134,B7,B85,C40,C52,C60,C79,D3
`Chr5:1184783`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A15,B10,B100,B105,B115,B134,B7,B85,C40,C52,C60,C79,D3
`Chr5:1184806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B27
`Chr5:1184822`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B120,B137,B3,B35,B6,B91,C6
`Chr5:1184917`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810259.1

865 aa

432

865

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 161-328 aa PF23598 LRR_14 554-815 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810259.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	161	328	1.1e-26	94.2	NB-ARC domain
`XP_057810259.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	554	815	1.4e-15	57.6	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954276.1
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCCACTTCTCTCAAGAATACGATTCACCGTATTCTACAATCGTCTAGCATTTCTCACGTTTCCCACTCTCCACAAATCTTACAACCTGCCTACGACGAGATGGATCGCTTGCAGAGAGTTCTGCTAGGATTGGACGAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGGAGGTGAATGCTTTGGATGAACGAATCAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATATCTTACCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024737
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCCACTTCTCTCAAGAATACGATTCACCGTATTCTACAATCGTCTAGCATTTCTCACGTTTCCCACTCTCCACAAATCTTACAACCTGCCTACGACGAGATGGATCGCTTGCAGAGAGTTCTGCTAGGATTGGACGAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGGAGGTGAATGCTTTGGATGAACGAATCAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATATCTTACCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810259.1
MAAYGAATSLKNTIHRILQSSSISHVSHSPQILQPAYDEMDRLQRVLLGLDETSCSKIRTEVNALDERIKEAVWEFEDLLESHILPQILPQLESERHNLSFSVDLQSLQHSVDCFVEKVKTMEVEYFIEVKNMPEEEGEPISSRIDSGGMIKSKMVGLSDEFEHARDYLLQGNNNEPFSIIGMAGVGKTTLAKHIFEDPSIRSHFEFRAWVKVGRKCESDELLRCILAQVDPNAYQMLTQGDDEEEELIGVLKERLRSKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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