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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000153`

染色体: Chr05 坐标: 1242503-1247150 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000153`
名称	SmilChr05G000153
描述	disease resistance RPP13-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1242503 - 1247150 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024739`
GeneID	`131024739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024739`
原始查询	`LOC131024739`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP13-like protein 4
产物	disease resistance RPP13-like protein 4
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=32.9; qcov=0.333; evalue=1.09e-27; confidence=low
Rice	`Os12g0564800` - identity=28.9; qcov=0.349; evalue=1.96e-29; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057810261.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810261.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810261.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810261.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810261.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1242517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:1242555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C8
`Chr5:1242571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B9,C28
`Chr5:1242576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:1242577`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A14,A24,A9,B101,B104,B105,B107,B12,B135,B19,B42,B43,B50,B6,B83,B84,B87,B93,C17,C35,C5,C57,C59,C70,C80,C84,C87
`Chr5:1242601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B82,C28
`Chr5:1242605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B82,C28
`Chr5:1242622`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C37
`Chr5:1242622`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C37
`Chr5:1242656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B82
`Chr5:1242659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,C22,C40,C52
`Chr5:1242667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810261.1

912 aa

456

912

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 233-400 aa PF00931 NB-ARC 843-907 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810261.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	233	400	7.1e-46	156.6	NB-ARC domain
`XP_057810261.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	843	907	7.1e-46	156.6	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954278.1
ATGGCGTTCATGGTGGTATCATCAATCAATACATGTGTAGAGCTGACTTTGTGTAGAGGCACAACCAATCTCATTTTAGGAATTGCACCATCAAAATCCTTATCCTCCCACCACCTACCGCCGTTGCCATTTCAGACCTTCTACCACCACCACCACCACCACCACAAACTCTCCCCACCTATTTTTGCCGTTGATAACTCATATTTCAATCAAGTTATGGCGGCTTATGCTGCGGCGGCTTCTCTCAAGAATACGATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024739
ATGGCGTTCATGGTGGTATCATCAATCAATACATGTGTAGAGCTGACTTTGTGTAGAGGCACAACCAATCTCATTTTAGGAATTGCACCATCAAAATCCTTATCCTCCCACCACCTACCGCCGTTGCCATTTCAGACCTTCTACCACCACCACCACCACCACCACAAACTCTCCCCACCTATTTTTGCCGTTGATAACTCATATTTCAATCAAGTTATGGCGGCTTATGCTGCGGCGGCTTCTCTCAAGAATACGATTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810261.1
MAFMVVSSINTCVELTLCRGTTNLILGIAPSKSLSSHHLPPLPFQTFYHHHHHHHKLSPPIFAVDNSYFNQVMAAYAAAASLKNTIQRILQSSRISLVSHSPQILQPAYDEMDRLQRVLLGLDETSCSKIRTEVNAADERIKEAVWEFEDLLESHILPQILPQLESSRDHLSFPVDLQSLQHHVDCFVEMVKMMEEEYTIEVENMAEEEGEPISSRIDIGGMIKSKMVGLSHEFEKARDYLLEENNKLPYSIIGMAGVGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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