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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000190`

染色体: Chr05 坐标: 1513028-1515631 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000190`
名称	SmilChr05G000190
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1513028 - 1515631 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024749`
GeneID	`131024749`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024749`
原始查询	`LOC131024749`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
Arabidopsis	`AT3G14460` (AT3G14460) LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820669] identity=29.9; qcov=0.395; evalue=2.6e-21; confidence=low
Rice	`Os11g0227700` - identity=31.1; qcov=0.359; evalue=6.78e-24; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024749

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057810269.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810269.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810269.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810269.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810269.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1513029`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A14,B10,B101,B107,B128,B23,B50,B57,B65,B75,B97,C33,C40,C73,D4,D6
`Chr5:1513039`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B13,B30,B39,B42,B44,B47,B60,C24,C41,C51,C56,C9
`Chr5:1513043`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	83	A16,A18,A24,A3,A4,A5,A9,B10,B103,B106,B112,B113,B120,B128,B131,B133,B135,B15,B16,B19,B2,B21,B26,B45,B46,B50,B52,B55,B58,B6,B64,B66,B67,B69,B71,B75,B78,B79,B80,B83,B84,B93,B97,B98,C1,C15,C16,C18,C19,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C33,C35,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C45,C51,C53,C57,C58,C63,C64,C66,C67,C70,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C84,C9,D2,D3
`Chr5:1513047`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	84	A16,A18,A24,A3,A5,A9,B10,B103,B106,B112,B113,B120,B128,B131,B133,B135,B15,B16,B18,B19,B2,B21,B26,B45,B46,B50,B52,B55,B58,B6,B64,B66,B67,B69,B71,B75,B78,B79,B80,B83,B84,B93,B97,B98,C1,C15,C16,C18,C19,C21,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C33,C35,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C45,C53,C57,C58,C59,C63,C64,C66,C67,C70,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C84,D2,D3,D9
`Chr5:1513050`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A1,A11,A23,B103,B119,B120,B130,B133,B139,B16,B22,B24,B25,B35,B41,B42,B47,B48,B62,B67,B70,B75,B83,C25,C34,C39,C57,C59,C72,C81,D3
`Chr5:1513064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B75,C59
`Chr5:1513069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B123
`Chr5:1513111`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A2,A7,B121,B29,C41,C46,C69,C71,C78,C80
`Chr5:1513126`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A23,B103,B119,B120,B133,B139,B22,B35,B42,B43,B47,B48,B62,B67,B73,B74,B75,C13,C34,C57,C72,C81
`Chr5:1513149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:1513180`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B62
`Chr5:1513180`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810269.1

679 aa

340

679

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 173-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810269.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	173	326	1.2e-27	97.2	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954286.1
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCCACTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTGTCCCACTCTCCACTAATCTTACCGCCTGTCTACGACCAGATGGATCGATTGCAGAGAGTTCTGCAATTATTGGACAAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGGAGGTGAATGCTTTGGATGAACTTATAAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATCTCTTACCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024749
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCCACTTCTCTCAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTGTCCCACTCTCCACTAATCTTACCGCCTGTCTACGACCAGATGGATCGATTGCAGAGAGTTCTGCAATTATTGGACAAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGGAGGTGAATGCTTTGGATGAACTTATAAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATCTCTTACCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810269.1
MAAYGAATSLKNTIQRILQSSRISLVSHSPLILPPVYDQMDRLQRVLQLLDKTSCSKIRTEVNALDELIKEAVWEFEDLLESHLLPQILPQLESERHNLSFSVDLQSLQHHVDCFVEMVKMMEEEYIIGIKNMPEEEGEPISSRIDFGGIKSKMVGLSYEFQKAGDDLLEDKHYSIVGMAGVGKTTLAKHIFEDPSIQSHFDFRIWVKVGRKYEHNELLCCVLAQVAPIAYRMLAQGDNDDEELVGLLKEKLQDKKCLIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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