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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000282`

染色体: Chr05 坐标: 2182256-2184844 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000282`
名称	SmilChr05G000282
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2182256 - 2184844 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024764`
GeneID	`131024764`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024764`
原始查询	`LOC131024764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=26.3; qcov=1.03; evalue=9.22e-71; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=31.6; qcov=0.606; evalue=2.19e-69; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024764

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057810285.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810285.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810285.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810285.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2182259`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	85	A10,A20,A7,B1,B103,B104,B105,B106,B109,B11,B110,B117,B119,B121,B125,B126,B133,B134,B139,B19,B2,B22,B23,B31,B32,B35,B36,B38,B42,B43,B44,B45,B47,B49,B5,B56,B58,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B76,B79,B8,B80,B81,B83,B88,B91,B93,B96,B98,B99,C18,C2,C24,C26,C27,C29,C39,C4,C40,C41,C46,C50,C55,C57,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C72,C74,C75,C77,C81,C83,C87,C9,D6
`Chr5:2182261`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B139,B85,C26,C82
`Chr5:2182261`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B139,B85,C26,C82
`Chr5:2182268`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	85	A10,A20,A7,B1,B103,B104,B105,B106,B109,B11,B110,B117,B119,B121,B125,B126,B133,B134,B139,B19,B2,B22,B23,B31,B32,B35,B36,B38,B42,B43,B44,B45,B47,B49,B5,B56,B58,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B76,B79,B8,B80,B81,B83,B88,B91,B93,B96,B98,B99,C18,C2,C24,C26,C27,C29,C39,C4,C40,C41,C46,C50,C55,C57,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C72,C74,C75,C77,C81,C83,C87,C9,D6
`Chr5:2182270`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	84	A10,A20,A7,B1,B103,B104,B105,B106,B109,B11,B110,B117,B119,B121,B125,B126,B133,B134,B139,B19,B2,B22,B23,B31,B32,B35,B36,B38,B42,B43,B44,B45,B47,B49,B5,B56,B58,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B76,B79,B8,B80,B81,B83,B88,B91,B93,B96,B98,B99,C18,C2,C24,C27,C29,C39,C4,C40,C41,C46,C50,C55,C57,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C72,C74,C75,C77,C81,C83,C87,C9,D6
`Chr5:2182293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B139,B30,C40
`Chr5:2182302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,B9,C51
`Chr5:2182422`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A2,C69,D10
`Chr5:2182422`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A2,C69,D10
`Chr5:2182426`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A2,C69
`Chr5:2182426`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A2,C69
`Chr5:2182432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810285.1

862 aa

431

862

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 158-321 aa PF23559 WHD_DRP 407-478 aa PF23598 LRR_14 524-781 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810285.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	158	321	2.3e-41	142.0	NB-ARC domain
`XP_057810285.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	407	478	2e-19	70.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057810285.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	524	781	6.2e-12	45.7	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954302.1
ATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTACTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCTACCCCTCCTATTTCTCTCCCCATCCAACAATTTGAATCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTCCAATTTCTCCAAGCCTATAATCCCCATCGTGACTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTGTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAACACGCCATTGAATCTCATATTTTCAAAAAGTTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024764
ATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTACTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCTACCCCTCCTATTTCTCTCCCCATCCAACAATTTGAATCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTCCAATTTCTCCAAGCCTATAATCCCCATCGTGACTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTGTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAACACGCCATTGAATCTCATATTTTCAAAAAGTTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810285.1
MAAAYATLLSAMNIINNLHHHPTPPISLPIQQFESLTQKINFLLQFLQAYNPHRDYSKEADPLECRIADAAYAAEHAIESHIFKKFTNNGENMSSLGLYEALEKVIKDMASIEEEAKQIQARVGAQHQLDTKSTPSDSSRSSSIPQQSIMVGADDVKLQLMDKLTSDGLHLQIIPIVGMGGSGKTTLARTVYEERLIKEHFDICGWATISQEYVIREIFAAVLRHLNVRVDDDLSEHELGEKLYKHLYGRKYLIIMDDMW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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