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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000309`

染色体: Chr05 坐标: 2339908-2342613 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000309`
名称	SmilChr05G000309
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2339908 - 2342613 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024769`
GeneID	`131024769`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024769`
原始查询	`LOC131024769`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=25.6; qcov=0.974; evalue=8.58e-75; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=30.8; qcov=0.598; evalue=1.87e-66; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024769

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057810290.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057810290.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810290.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810290.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810290.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2339913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C11
`Chr5:2339953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A23,A4,B105,B111,B138,B27,B37,B59,B64,B67,B7,B70,B74,B76,B77,B8,B83,B93,B94,C12,C15,C21,C36,C46,C53,C60,C65,C73,C74,C75,C8,C84,D2
`Chr5:2339977`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B133,B43,B58,B83,C18,C45
`Chr5:2340017`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A7,B27,B43,B58,B83,C11,C45,C66
`Chr5:2340046`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B129,B138,B73,B86,C17
`Chr5:2340046`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B129,B138,B73,B86,C17
`Chr5:2340048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B28,B85,B94
`Chr5:2340059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,D9
`Chr5:2340090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B37,C32
`Chr5:2340135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B16,B52,C64
`Chr5:2340174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C70
`Chr5:2340193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B98,C11,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810290.1

901 aa

450

901

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 215-377 aa PF23559 WHD_DRP 463-534 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810290.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	215	377	1.6e-39	135.9	NB-ARC domain
`XP_057810290.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	463	534	5.1e-19	68.8	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954307.1
ATGGACAATACTGCTGCTCCAGTGGCTATCTCTCAGTCTGAATGGCAGAATTTGAGAATTCCTAATCACAGTCTCTCATCTTCATTCACACTCACCTCATCATCTCATATTCTGCTTCTCTCTGCAACTCCCAAAACAACCATGGCAGCTGCTTATGCAACTCTAGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCATCATCATCCTAACCCTCCTATTTCTCTCCACATTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024769
ATGGACAATACTGCTGCTCCAGTGGCTATCTCTCAGTCTGAATGGCAGAATTTGAGAATTCCTAATCACAGTCTCTCATCTTCATTCACACTCACCTCATCATCTCATATTCTGCTTCTCTCTGCAACTCCCAAAACAACCATGGCAGCTGCTTATGCAACTCTAGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCATCATCATCCTAACCCTCCTATTTCTCTCCACATTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810290.1
MDNTAAPVAISQSEWQNLRIPNHSLSSSFTLTSSSHILLLSATPKTTMAAAYATLVSAMNIINNLHHHPNPPISLHIKQVESLTQKINFLLEFLQGYNPHRDYCKEADPLECRIADAAYAVEHAIESHILDQFINNAENIVHLSKRKKRKKNMSYDGLCEALEKVIEDMASIEEEAKQIQGRVEVQVQHQLPPDSSRSSSIPQQSSMVGADDVKLQMMDKLISDDDLQIIPIVGMGGSGKTTLARTVYEERLIKEHFDIC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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