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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000313`

染色体: Chr05 坐标: 2361014-2363593 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000313`
名称	SmilChr05G000313
描述	late blight resistance protein R1-A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	2361014 - 2363593 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024771`
GeneID	`131024771`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024771`
原始查询	`LOC131024771`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late blight resistance protein R1-A-like
产物	late blight resistance protein R1-A-like
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=25.9; qcov=1.02; evalue=2.32e-66; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=35.8; qcov=0.426; evalue=2.28e-62; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024771

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057810293.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810293.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810293.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810293.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810293.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:2361024`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C42,C82
`Chr5:2361024`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C42,C82
`Chr5:2361055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B61,B8,D11
`Chr5:2361061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:2361068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B15,B70
`Chr5:2361070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:2361077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B21,B45
`Chr5:2361083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:2361097`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C42
`Chr5:2361097`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C42
`Chr5:2361100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,C10,C15,C61,C74
`Chr5:2361110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B95,C15,C42,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810293.1

859 aa

430

859

NB-ARC

AAA_22

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 150-317 aa PF13401 AAA_22 167-254 aa PF23559 WHD_DRP 402-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810293.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	150	317	1.8e-39	135.8	NB-ARC domain
`XP_057810293.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	167	254	3.8e-07	31.2	AAA domain
`XP_057810293.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	402	485	1.1e-16	61.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954310.1
ATGACAGCAGCTTATGCATCTCTGGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCTCGCCCTCCTATTTCTCTCCACATTCAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTCCAATTTCTCCAAGGCTATAACCCCCATCGTGACTACTCCAAAGAAGCAGATCCATTGGAATGTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCTGCCGAATGCACCATTGAATCTCATATTTTAAATCAGTTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024771
ATGACAGCAGCTTATGCATCTCTGGTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCTCGCCCTCCTATTTCTCTCCACATTCAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTCCAATTTCTCCAAGGCTATAACCCCCATCGTGACTACTCCAAAGAAGCAGATCCATTGGAATGTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCTGCCGAATGCACCATTGAATCTCATATTTTAAATCAGTTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810293.1
MTAAYASLVSAMNIINNLHHHPRPPISLHIQQVESLTQKINFLLQFLQGYNPHRDYSKEADPLECRIADAAYAAECTIESHILNQFTNNGENMSDDGLYEALEKVIKDMASIEEEAKQSQARVGFQHQLHSDSSRSSSIPQQSIIVGADDLKRQMMDKLTSDCRDLQITSIVGMGGSGKTTLARTVCEERLIKKHFHICAWATISQEYSIREIFAALLRQLNIRVDDNLREHELGFKLYQHLYHRRYLIIMDDMWSIDAW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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