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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000407`

染色体: Chr05 坐标: 3068336-3069490 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000407`
名称	SmilChr05G000407
描述	uncharacterized SmilChr05G000407
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3068336 - 3069490 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024788`
GeneID	`131024788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024788`
原始查询	`LOC131024788`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G17920` (AT2G17920) nucleic acid binding / zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816302] identity=24.2; qcov=0.591; evalue=1.19e-19; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=29.9; qcov=0.513; evalue=1.4e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810308.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057810308.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057810308.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810308.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810308.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3068351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B134
`Chr5:3068353`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B124,B52,B98
`Chr5:3068353`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B124,B52,B98
`Chr5:3068356`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B124,B52,B98
`Chr5:3068356`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B124,B52,B98
`Chr5:3068360`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B124,B52,B98
`Chr5:3068360`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B124,B52,B98
`Chr5:3068362`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B124,B52,B98
`Chr5:3068362`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B124,B52,B98
`Chr5:3068367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B52,B98
`Chr5:3068369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr5:3068370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810308.1

384 aa

192

384

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 31-107 aa PF14392 zf-CCHC_4 170-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810308.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	31	107	3.1e-19	69.2	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057810308.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	170	217	1.1e-18	67.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954325.1
ATGGAGGAGCGCATGGCCGGACTAAAACTATCTGCTGAAGAGGACGAACTCCTCATTGATGATGATATCGCTGACGACACCACGGTAGCGGTTGAACTATGCTTGGTGGGCCGGTTTCTCACTGAGCAGCCGATAAACTTCAATCTCATGCGAAGCAGACTGGCAAGCATCTGGCGACCCGGGAAAGGAGTCTTCATGAAAGATATTGGGGACGGCAGATTCATATTCCAATTCTTTCATGAACTGGATCTTCAGCGTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024788
ATGGAGGAGCGCATGGCCGGACTAAAACTATCTGCTGAAGAGGACGAACTCCTCATTGATGATGATATCGCTGACGACACCACGGTAGCGGTTGAACTATGCTTGGTGGGCCGGTTTCTCACTGAGCAGCCGATAAACTTCAATCTCATGCGAAGCAGACTGGCAAGCATCTGGCGACCCGGGAAAGGAGTCTTCATGAAAGATATTGGGGACGGCAGATTCATATTCCAATTCTTTCATGAACTGGATCTTCAGCGTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810308.1
MEERMAGLKLSAEEDELLIDDDIADDTTVAVELCLVGRFLTEQPINFNLMRSRLASIWRPGKGVFMKDIGDGRFIFQFFHELDLQRILDNGPWSYGNFPLILHKLKKGDLPSKVPLDTLPFWIQIHDLPAGFLTEKVGRLLGNFIGNFLEYDSTNSSGVWRQYMRIRVGINVTEPLKRFKRLKNTDGTSFQVSFKYERLNIFCFLCGRLGHSENFCNLRFTLEVKEVEREWGAWLKAADRRSVSLAGDKWLRADDGGSNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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