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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002363`

染色体: Chr01 坐标: 40781386-40782386 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002363`
名称	SmilChr01G002363
描述	uncharacterized SmilChr01G002363
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40781386 - 40782386 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024790`
GeneID	`131024790`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024790`
原始查询	`LOC131024790`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G05642` (AT2G05642) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430] identity=36.2; qcov=0.648; evalue=3.4e-09; confidence=low
Rice	`Os07g0113000` - identity=29.5; qcov=0.655; evalue=1.99e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02721 (DUF223)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024790

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810312.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057810312.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057810312.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810312.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810312.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40781653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr1:40781714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D10
`Chr1:40781774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:40781819`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B54
`Chr1:40781819`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B54
`Chr1:40781842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:40781845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,A3,B81,C75
`Chr1:40781859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr1:40781863`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A16,B114,B19,B26,C2,C44,C50,C51,C55,C84
`Chr1:40781870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr1:40781880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C14,D10
`Chr1:40781910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810312.1

145 aa

145

DUF223

PF02721 DUF223 18-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810312.1`	Pfam	`PF02721`	DUF223	Domain	18	124	1.8e-14	54.6	Domain of unknown function DUF223

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954329.1
CTCTGCTCTGGTCTCTTCTCTATGCTTTTCTATACTCTGTCCGCTATAACCTCTTTATGCTCTGCTCTCTTATCTCTGCTCTCCTCTACTATATCCGCTATCTTCTCTCTCTGCTCTGCTATGCTCTTTCCTCTTTGATATCAATATGTTTTGTTTTTTATTCTTTTTTAATAAACTTTATATTTCAGCAGATATTTATCTGTTTTGTTCTCAACGAAGGAAATGACGACAAGGAATGGAATCATTCAAATCAACTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024790
ATGACGACAAGGAATGGAATCATTCAAATCAACTCCATCGATAAAAAAACTTGGAATAAAAGGGTCGTCGTTAGAATATTGCGGCTTTGGGTTCAAAAGGATTTAACAGGCCGAGAAGGCTTGGAGATGATTTTAATCGATGAATGGGGCAATCAAATTCAAGCATCTGTCTCTTTTGGAAATAAAAGGAAGTTTATGCCTCTTTTGAGAGAGGGAGATATAAATATGATCCAAAATTTCCAAGTAATGGACAACAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810312.1
MTTRNGIIQINSIDKKTWNKRVVVRILRLWVQKDLTGREGLEMILIDEWGNQIQASVSFGNKRKFMPLLREGDINMIQNFQVMDNKPNFQMAKVDHLYMLGFGLATQIEQPDEASKFWKMDLILFPLQIFLHTIPLSFWMFLGRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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