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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000441`

染色体: Chr05 坐标: 3335967-3337073 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000441`
名称	SmilChr05G000441
描述	uncharacterized SmilChr05G000441
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	3335967 - 3337073 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024791`
GeneID	`131024791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024791`
原始查询	`LOC131024791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841728]; symbol=AT1G52950; hit=AT1G52950; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841728]; symbol=AT1G52950; hit=AT1G52950; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G52950` (AT1G52950) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841728] identity=26.9; qcov=0.879; evalue=6.11e-10; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02721 (DUF223)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810310.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057810310.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057810310.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810310.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810310.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:3335986`	`T`	`TC`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B122
`Chr5:3335986`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B122
`Chr5:3335994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B45,C61,C76
`Chr5:3335994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C61,C76
`Chr5:3336152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:3336183`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A1,B107,B128,B133,B19,B25,B40,B45,B47,B50,B55,B66,B84,B86,C17,C19,C23,C30,C34,C35,C36,C5,C54,C64,C76,C9,D9
`Chr5:3336192`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A25,B2,B58,B66,C84
`Chr5:3336192`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A25,B2,B58,B66,C84
`Chr5:3336298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:3336371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,B98
`Chr5:3336387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr5:3336398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B104,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810310.1

190 aa

190

DUF223

PF02721 DUF223 14-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810310.1`	Pfam	`PF02721`	DUF223	Domain	14	130	1.5e-18	67.8	Domain of unknown function DUF223

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954327.1
TTATAAGGCAATGAATCAATGCTAGCTTCTTTCTGCTCACCTTTTATATGCTTGCCTTATTTGTGGGTGTGAAATCATCTGCTGTCTTCAGTAAAAACATGCAAATATGTGGTTATGGGGTTTTGTACTTCTCCTTTTGAACATACAGTATTAAAAGATAGGAGTATTTTACATTGTATACTTTTTTCCTTTGCAAAATAATTTTCTTGCCAATCGTGTGAATAATAGCATATTTGATAATTTATTTACTTACTCTAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024791
ATGTCGACGAATAATGAAGCTATTCCTTTGAGCATCATCAAGGAAAAAATACGAAATAAATATGTGGTTGTCAGAATTTTGCGCTTATGGGTTCAAAAAGATAAATTGGGCAAGGAAGGACTTGAAATGATCGTGATTGATGAATGGGGCAACAAAATTCAAGCATCCGTCTCAACAGTGAACAAGAATAAGTTTCATGAGTTACTTAAAGAGGGACAAATAACCGTTATTAAAAACTTCCAAGTAGTGAAAAACAATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810310.1
MSTNNEAIPLSIIKEKIRNKYVVVRILRLWVQKDKLGKEGLEMIVIDEWGNKIQASVSTVNKNKFHELLKEGQITVIKNFQVVKNNPNFQHAKINHEWKISFTFRTIVYESTERPNITENGFDFIHFRNIHSHDQELVLDILGEVKTENITIDCVEMKHGKAKKCDITLADADGTQVICVLWESYNIYLK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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