当前解析结果
SmilChr05G000507| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000507 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000507 |
| 描述 | BON1-associated protein 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 3930539 - 3931111 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024797 |
|---|---|
| GeneID | 131024797 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024797 |
| 原始查询 | LOC131024797 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BON1-associated protein 2-like |
| 产物 | BON1-associated protein 2-like |
| Arabidopsis | AT2G13350 (AT2G13350)Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815821] identity=34.1; qcov=0.711; evalue=3.03e-09; confidence=low |
| Rice | Os01g0853800- identity=36.3; qcov=0.711; evalue=3.65e-11; confidence=low |
| GO | GO:0006952 (defense response) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00168 (C2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024797 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057810317.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057810317.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057810317.1 |
| 4 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057810317.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810317.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:3930576 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B11 |
Chr5:3930607 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr5:3930737 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C29,C72 |
Chr5:3930769 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr5:3930771 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr5:3930801 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B80,C86 |
Chr5:3930823 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr5:3930832 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B27,C48 |
Chr5:3930894 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C14,C35 |
Chr5:3930912 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C14,C35 |
Chr5:3930959 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B78 |
Chr5:3930959 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B78 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810317.1PF00168
C2 21-118 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810317.1 |
Pfam | PF00168 |
C2 | Domain | 21 | 118 | 1.8e-10 | 41.6 | C2 domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。