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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002364`

染色体: Chr01 坐标: 40806239-40815704 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002364`
名称	SmilChr01G002364
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 13-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40806239 - 40815704 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024799`
GeneID	`131024799`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024799`
原始查询	`LOC131024799`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 13-like
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 13-like
Arabidopsis	`AT4G17950` (AT4G17950) AT hook motif DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827520] identity=51.8; qcov=0.749; evalue=6.45e-70; confidence=high
Rice	`Os10g0572900` - identity=60.6; qcov=0.65; evalue=7.92e-78; confidence=high
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024799

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810319.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810319.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810319.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810319.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810319.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40806467`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C70
`Chr1:40806467`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C70
`Chr1:40806503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B25,C23,D5
`Chr1:40806508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B66,C5,C61,D7
`Chr1:40806725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,A3,B103
`Chr1:40806841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:40806847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr1:40806863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B66,C5,C61,D7
`Chr1:40808484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,B86,C44,C87
`Chr1:40814806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B74,C16
`Chr1:40815136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr1:40815224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810319.1

363 aa

182

363

PCC

PF03479 PCC 163-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810319.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	163	279	2.9e-35	121.7	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954336.1
GAGTTTGAGTTTGTTAGTTGGAGATGGCCTAATCAATCCTGATTCCTGCCAAATGAGTCATATGGTAAGAAGTAAAGTAAGAACTCTAAGGGGATGTTTGGCTATTGTTACAAAACATTAAACCCTAATTTTAAACCCTATTTTGGCTTTTTTCACTGATTCCCCCAGTTTGTGACCGATCCTCGGACACACTTAGTTAAAGATTCACTGCAGCATCCAATGGATTCACAAGATTCCTCTGCGCCACCACCCCACCTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024799
ATGGATTCACAAGATTCCTCTGCGCCACCACCCCACCTGAGCCACCTCCACCACCACCCTCAACCGTCGCATCCCGCCGCCCTACACACTCAGCCGCAACGCCACCTGCCCAGCAACTCCTACCTACTCCCCAACAGCAACAATGCCGTCAACCCCACCACCACCACTCACACGCACCAGCAAAACCCTGGCTTCCCGTTCAATTCCATGGCCGGCGGCGCCCCGAAGCCGCTGGATCATCTTCAGCCCGATGGGTCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810319.1
MDSQDSSAPPPHLSHLHHHPQPSHPAALHTQPQRHLPSNSYLLPNSNNAVNPTTTTHTHQQNPGFPFNSMAGGAPKPLDHLQPDGSPSGARKKRGRPRKYSPDNSIGLGLSPAPVSQIPTLMAHNDSGGGGTPPSEMSAKRNRGRPPGTVKRQLDALGVPGVGFTPHVITVNAGEDIASKILAFSQQGPRTVCILSANGAICNVTLRQPAMSGGGVTYEGRFEIISLSGSFLLSESIGNCSRTGGLSISLAGSDGRVLGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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