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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000612`

染色体: Chr05 坐标: 4607518-4608783 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000612`
名称	SmilChr05G000612
描述	uncharacterized SmilChr05G000612
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	4607518 - 4608783 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024808`
GeneID	`131024808`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024808`
原始查询	`LOC131024808`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G22970; symbol=AT3G22970; hit=AT3G22970; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT3G22970; symbol=AT3G22970; hit=AT3G22970; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G22970` (AT3G22970) - identity=47.1; qcov=1.04; evalue=3.49e-30; confidence=medium
Rice	`Os10g0417800` - identity=35.4; qcov=0.798; evalue=3.38e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04720 (PDDEXK_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024808

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057810326.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057810326.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810326.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810326.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:4607527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B44,B73,C23
`Chr5:4607527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B73,C23
`Chr5:4607581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:4607592`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	24	A5,B108,B12,B129,B25,B29,B55,B56,B78,B84,B9,B96,B99,C14,C2,C22,C32,C37,C51,C68,C7,C79,C8,C83
`Chr5:4607601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C23
`Chr5:4607602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	114	A11,A13,A15,A18,A19,A21,A22,A23,A3,A5,A6,B10,B103,B105,B107,B108,B112,B117,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B13,B135,B139,B140,B16,B17,B2,B21,B23,B24,B25,B28,B29,B3,B30,B32,B36,B38,B39,B40,B41,B44,B51,B55,B56,B58,B61,B65,B67,B68,B73,B74,B75,B78,B8,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B9,B93,B96,B99,C1,C13,C14,C15,C16,C2,C20,C22,C23,C24,C26,C29,C31,C32,C34,C37,C4,C41,C47,C48,C49,C51,C52,C54,C57,C6,C62,C67,C68,C7,C71,C79,C8,C81,C83,C84,C9,D10,D11,D5,D8
`Chr5:4607606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B90,B92
`Chr5:4607677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B128,B2
`Chr5:4607678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:4607684`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	98	A11,A13,A15,A18,A19,A21,A23,A3,A5,A6,B10,B103,B105,B107,B108,B112,B117,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B135,B139,B140,B17,B2,B23,B24,B25,B29,B30,B32,B40,B41,B49,B55,B56,B58,B61,B67,B68,B72,B74,B75,B78,B8,B81,B82,B83,B86,B87,B88,B9,B96,B99,C1,C13,C14,C15,C16,C2,C20,C22,C24,C29,C30,C31,C32,C34,C37,C41,C47,C48,C49,C51,C52,C54,C57,C6,C67,C68,C7,C71,C79,C8,C83,C84,C9,D10,D11,D4,D5,D8
`Chr5:4607692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:4607722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810326.1

163 aa

163

PDDEXK_6

PF04720 PDDEXK_6 66-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810326.1`	Pfam	`PF04720`	PDDEXK_6	Family	66	152	2e-05	25.4	PDDEXK-like family of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954343.1
ATGAGAATCCAGCCGATCGACAGTTTGTCGAGCAACGTCGTCAAGTCGTCGGTGCTTAAGTTACGGCTTAAGCGGTTTTTTGACCGACCGTTCAACGGCGTCCTCCGGATTTCATCCGTTGAGAAGCTGGTCGCCAGAGGAGATAAAGATGGCGGTGGCGCTGCCAAATTCGAGCCGAGCTCAGTATGTTTGGATAAAATGGTTCAGAATTTCATGGAGGACAACAACGAGAAAACCTCCCTCCCTCCACTGCCGCTAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024808
ATGAGAATCCAGCCGATCGACAGTTTGTCGAGCAACGTCGTCAAGTCGTCGGTGCTTAAGTTACGGCTTAAGCGGTTTTTTGACCGACCGTTCAACGGCGTCCTCCGGATTTCATCCGTTGAGAAGCTGGTCGCCAGAGGAGATAAAGATGGCGGTGGCGCTGCCAAATTCGAGCCGAGCTCAGTATGTTTGGATAAAATGGTTCAGAATTTCATGGAGGACAACAACGAGAAAACCTCCCTCCCTCCACTGCCGCTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810326.1
MRIQPIDSLSSNVVKSSVLKLRLKRFFDRPFNGVLRISSVEKLVARGDKDGGGAAKFEPSSVCLDKMVQNFMEDNNEKTSLPPLPLGMAIGSDDKLDFFSDSISANSSFDDPFDTLRNLIPCATVSERNLLAHTLKIVEKNNRTYKRKRRLKGNSHRWSNSGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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