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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003792`

染色体: Chr05 坐标: 51258290-51261994 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003792`
名称	SmilChr05G003792
描述	aspartyl protease family protein At5g10770-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51258290 - 51261994 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024855`
GeneID	`131024855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024855`
原始查询	`LOC131024855`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease family protein At5g10770-like
产物	aspartyl protease family protein At5g10770-like
Arabidopsis	`AT5G10770` (AT5G10770) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830944] identity=55.9; qcov=0.872; evalue=7.25e-168; confidence=high
Rice	`Os06g0610800` (P0490F09.29-1) - identity=47.5; qcov=0.893; evalue=6.69e-134; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024855

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057810384.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057810384.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810384.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810384.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810384.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51258565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:51258584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr5:51258644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B129,B71
`Chr5:51258761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:51258772`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B14,B26
`Chr5:51258772`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B14,B26
`Chr5:51258877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,C12,C3,C8
`Chr5:51259151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:51259466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C11,C69
`Chr5:51259540`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	52	A14,A21,A22,A24,A5,A9,B1,B102,B107,B112,B115,B119,B121,B126,B129,B132,B22,B23,B24,B26,B28,B32,B34,B40,B51,B53,B54,B61,B66,B68,B71,B73,B77,B79,B80,B81,B87,B89,B90,B91,B92,C11,C22,C26,C36,C48,C55,C57,C61,C69,C77,C87
`Chr5:51259545`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	47	A14,A21,A22,A24,A5,A9,B1,B102,B107,B112,B115,B119,B121,B126,B129,B132,B22,B23,B26,B28,B32,B34,B40,B51,B54,B61,B68,B71,B73,B77,B79,B80,B81,B87,B89,B90,B91,B92,C22,C26,C36,C48,C55,C57,C61,C77,C87
`Chr5:51259561`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A22,B101,B122,B68,C20,C3,C50,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810384.1

486 aa

243

486

Asp

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF00026 Asp 144-218 aa PF14543 TAXi_N 145-314 aa PF00026 Asp 218-482 aa PF14541 TAXi_C 335-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810384.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	144	218	1.3e-24	88.0	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057810384.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	145	314	2e-54	185.2	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057810384.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	218	482	1.3e-24	88.0	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057810384.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	335	481	1.8e-29	103.4	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954401.1
AAACCAATGGGAATAGAATAATATTATCATAGTGGGGTGACCTGTACCTTCTTGAAAAAAAAGATAAAAAGAAGAACATTCCCTATATATGTGTGATGATGGTCTGCACACAAATTCCATAACTTTATTTTTTCATAACAAACAATCAAACTTTGTGGAATAGTATAGCCATAGAAAAAAAGGTGAATTCTTCACTTATGGCCTCTCTGAATGTGAAGATGAGAATATGTTGGTTTTTATTCACATTGATTTCATGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024855
ATGGCCTCTCTGAATGTGAAGATGAGAATATGTTGGTTTTTATTCACATTGATTTCATGTTTTGTGGAGAGAAGCAGTTGTTTTGAAAGCAGAAATGATGAGAGCCATTTTCATATCGTTGAAATCAGCTCTTTTTCTCCGGCAGATGTCTGCACTCACTCTACCATCAACGGTTTTAACAAGAGACAATCAAGCATGGAAATTCTCCATAGGCAAGGTCCATGTTTTCAACAAGGTCAAAATAAGGCCTATACATCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810384.1
MASLNVKMRICWFLFTLISCFVERSSCFESRNDESHFHIVEISSFSPADVCTHSTINGFNKRQSSMEILHRQGPCFQQGQNKAYTSPSLDEVLSHDQARVESIQARIDSNSNTNTNTNKIENFKWDSKKANLPVESGRSLGSGNYIVTVGLGTPKRSLSLMFDTGSDLTWTQCQPCVRSCYHQQEPIFNPSTSSSYKNISCKSAECSQLSSATGSSPGCATTTCVYGIQYGDQSFSVGYFSRDKLTISATDVFPSFLFGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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