当前解析结果
SmilChr05G003791| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003791 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003791 |
| 描述 | protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 51256272 - 51259748 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024856 |
|---|---|
| GeneID | 131024856 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024856 |
| 原始查询 | LOC131024856 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like |
| 产物 | protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2-like |
| Arabidopsis | AT5G10750 (AT5G10750)enhanced disease resistance-like protein (DUF1336) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830942] identity=61.7; qcov=0.889; evalue=3.44e-116; confidence=high |
| Rice | Os08g0152600 (OJ1349_D05.117)- identity=42.8; qcov=0.892; evalue=6.54e-76; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07059 (EDR2_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024856 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057810385.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057810385.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057810385.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810385.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810385.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:51256799 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B5,C52,C59,C71 |
Chr5:51256985 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,B66,B78 |
Chr5:51257252 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C14,C29,C72,D2 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810385.1PF07059
EDR2_C 48-261 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810385.1 |
Pfam | PF07059 |
EDR2_C | Domain | 48 | 261 | 3.1e-72 | 243.6 | Protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2, C-terminal |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。