当前解析结果
SmilChr05G003807| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003807 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003807 |
| 描述 | enhancer of rudimentary homolog |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 51370797 - 51373335 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024872 |
|---|---|
| GeneID | 131024872 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024872 |
| 原始查询 | LOC131024872 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | enhancer of rudimentary homolog |
| 产物 | enhancer of rudimentary homolog |
| Arabidopsis | AT5G10810 (ER)enhancer of rudimentary protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830948] identity=82.2; qcov=0.99; evalue=5.98e-61; confidence=high |
| Rice | Os04g0499200- identity=66.2; qcov=0.755; evalue=2.1e-36; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01133 (ER) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024872 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057810405.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057810405.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057810405.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057810405.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810405.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810405.1PF01133
ER 3-102 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810405.1 |
Pfam | PF01133 |
ER | Domain | 3 | 102 | 1.2e-46 | 157.7 | Enhancer of rudimentary |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。