Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003819`

染色体: Chr05 坐标: 51501445-51502250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003819`
名称	SmilChr05G003819
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51501445 - 51502250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024885`
GeneID	`131024885`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024885`
原始查询	`LOC131024885`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
产物	premnaspirodiene oxygenase-like
Arabidopsis	`AT3G26330` (CYP71B37) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 37 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822237] identity=51.1; qcov=0.984; evalue=1.51e-59; confidence=high
Rice	`Os03g0593600` (CYP71W1) - identity=54.8; qcov=0.995; evalue=1.07e-67; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024885

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057810421.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810421.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810421.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810421.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810421.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810421.1

187 aa

187

p450

PF00067 p450 1-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810421.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	1	164	5.8e-51	174.4	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954438.1
TTCTCAGCTGGAACTGAGACCTCATCATCAGCCATTGATTGGACGATAGTAGAACTAATGAAAAACACTAGAGTGATGGCCAAGGCACAAGCTGAACTAAGACAAGTCTTGAAAGAAGGCACTACTGCTACTACTTTAGAACAAAATGACGTTGTTCATAAACTGAAATATCTGAAACTGGTGATCAAAGAGAGTTTGAGGCTACACCCTCCAGTTCCAATGTTGCCTAGAGCTTCTAGGGAGGCATGCAAAGTCAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024885
ATGAAAAACACTAGAGTGATGGCCAAGGCACAAGCTGAACTAAGACAAGTCTTGAAAGAAGGCACTACTGCTACTACTTTAGAACAAAATGACGTTGTTCATAAACTGAAATATCTGAAACTGGTGATCAAAGAGAGTTTGAGGCTACACCCTCCAGTTCCAATGTTGCCTAGAGCTTCTAGGGAGGCATGCAAAGTCAAAGGATACACAATACCTGCTGATGTTAGGGTGATGGTGAATATTTGGGCTATGCATAGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810421.1
MKNTRVMAKAQAELRQVLKEGTTATTLEQNDVVHKLKYLKLVIKESLRLHPPVPMLPRASREACKVKGYTIPADVRVMVNIWAMHRDPNFWKDPERFEPERFENDGVDFTGGDFQYLPFGSGRRMCPGIMFGLATVELALAQLLYNFDWKLPEGVRVEDLDMIENDGITTSRKDNLFVVATPYKPSM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器