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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003824`

染色体: Chr05 坐标: 51623772-51631394 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003824`
名称	SmilChr05G003824
描述	pleiotropic drug resistance protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51623772 - 51631394 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024890`
GeneID	`131024890`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024890`
原始查询	`LOC131024890`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pleiotropic drug resistance protein 1-like
产物	pleiotropic drug resistance protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G15520` (ABCG40) pleiotropic drug resistance 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838122] identity=68.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0609300` (OsPDR9) - identity=68.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	smil02010 (ABC transporters - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF01061 (ABC2_membrane); PF08370 (PDR_assoc); PF14510 (ABC_trans_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024890

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810422.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057810422.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810422.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810422.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810422.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51630195`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A3,B113,B118,B88,C19,C21,C32,C46
`Chr5:51630216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,D3
`Chr5:51630227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C67
`Chr5:51630247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C21,C67
`Chr5:51630890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B131
`Chr5:51631128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810422.1

1448 aa

724

1448

ABC_trans_N

ABC_tran

ABC2_membrane

PDR_assoc

ABC_tran

ABC2_membrane

PF14510 ABC_trans_N 102-152 aa PF00005 ABC_tran 177-358 aa PF01061 ABC2_membrane 513-725 aa PF08370 PDR_assoc 730-790 aa PF00005 ABC_tran 879-1031 aa PF01061 ABC2_membrane 1176-1390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810422.1`	Pfam	`PF14510`	ABC_trans_N	Domain	102	152	3.5e-07	31.2	ABC-transporter N-terminal
`XP_057810422.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	177	358	3.8e-40	138.4	ABC transporter
`XP_057810422.1`	Pfam	`PF01061`	ABC2_membrane	Domain	513	725	6e-103	343.6	ABC-2 type transporter
`XP_057810422.1`	Pfam	`PF08370`	PDR_assoc	Family	730	790	9e-23	80.5	Plant PDR ABC transporter associated
`XP_057810422.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	879	1031	3.8e-40	138.4	ABC transporter
`XP_057810422.1`	Pfam	`PF01061`	ABC2_membrane	Domain	1176	1390	6e-103	343.6	ABC-2 type transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954439.1
ATGGATGCGGGCGATCTGTACAAAGCGAGTGGTAGCTTGAGATCAAGCAGCAAACGAGGTGAAAGCTTCAGAGTGAACAGCTCGAACATATGGAGGAACACAGGGTTGGAAGTGTTCACACGATCATCGCGTGAAGAAGATGATGAGGAGGCCTTGAAGTGGGCTGCGCTCGAGAAACTGCCCACGTTCGATCGCCTGAGGAGAGGCTTGCTGCTCGGATCAAGAGGCGCCAACGAGGTTGAGGTGCATGATCTGGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024890
ATGGATGCGGGCGATCTGTACAAAGCGAGTGGTAGCTTGAGATCAAGCAGCAAACGAGGTGAAAGCTTCAGAGTGAACAGCTCGAACATATGGAGGAACACAGGGTTGGAAGTGTTCACACGATCATCGCGTGAAGAAGATGATGAGGAGGCCTTGAAGTGGGCTGCGCTCGAGAAACTGCCCACGTTCGATCGCCTGAGGAGAGGCTTGCTGCTCGGATCAAGAGGCGCCAACGAGGTTGAGGTGCATGATCTGGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810422.1
MDAGDLYKASGSLRSSSKRGESFRVNSSNIWRNTGLEVFTRSSREEDDEEALKWAALEKLPTFDRLRRGLLLGSRGANEVEVHDLGIQDKKQLVERLVQTVEEDNEKFLLKLRNRIDRVGIDIPTIEVRYEHLNIDAEAFSASRALPTFVNFHINLVEGFLNALHILPSRKKPFTILKDVSGIIKPCRMTLLLGPPSSGKTTLLLALAGKLDPTLKVSGRITYNGHEMHEFVPQRTAAYISQHDLHIGEMTVRETLSFSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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