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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002373`

染色体: Chr01 坐标: 40952655-40959050 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002373`
名称	SmilChr01G002373
描述	vesicle-associated protein 1-2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40952655 - 40959050 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024891`
GeneID	`131024891`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024891`
原始查询	`LOC131024891`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle-associated protein 1-2-like
产物	vesicle-associated protein 1-2-like
Arabidopsis	`AT3G60600` (VAP27-1) vesicle associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825231] identity=43.5; qcov=0.572; evalue=5.83e-34; confidence=medium
Rice	`Os08g0155100` - identity=46.1; qcov=0.556; evalue=2.45e-36; confidence=medium
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0061817 (GO:0061817); GO:0090158 (endoplasmic reticulum membrane organization)
KEGG	-
Pfam	PF00635 (Motile_Sperm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024891

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057810424.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057810424.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810424.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810424.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40953023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:40953044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr1:40957369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr1:40957668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:40958612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810424.1

257 aa

128

257

Motile_Sperm

PF00635 Motile_Sperm 8-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810424.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	8	100	2.2e-24	86.1	MSP (Major sperm protein) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954441.1
AAGTATTGATGAGTGTACATTAGTTTATCAATTTTCTGGTTGGCGCCATTTTCTCTTCTCTCTCTCTTTTTCTTTCAATCTGCAACTTGCGATGTACCAGTTTCTTGACTTTGATTAATTTATAGACTTTTACCACTTCAACTTTTTGTTGCATTCTATTACAATAATTATCCCGTCGTTTTCTTTTCATATATCCATGTCTTCAATTCCACCTTCTCCAGATTTTTATCTATTTTCCCCTCTATTTTTCTTCTTCATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024891
ATGCCCATATCAGAAAAGCTTCTCAATATCGAACCTCGGGAGCTCTCTTTCCGCTTTGAGTTAATGGTGAAAGCATCTTGCACGATTCGATTGTCTAGTAACTCCTCAAGGCATGTTGCTTTTAAGGTTATGACTACAAGCCCACAAAAGTATTTTGTTAAACCAAATCTTGGAATTCTTTCGCCTGGATCAACTTGTGACGTTGAAGTAATTATGCGTGCTCCAGAGGAGATCCCTCCTAACATGGAATGCAGGGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810424.1
MPISEKLLNIEPRELSFRFELMVKASCTIRLSSNSSRHVAFKVMTTSPQKYFVKPNLGILSPGSTCDVEVIMRAPEEIPPNMECRDKFLIKSVVAGPDDTVVRVKKLFNDRAHAVGDYKLRVVYVLPQHQQSPNFDRTGRGSSLNGSILQERSLSGTQLEDINNERVVDNLYVKGIAIIFVGLIFLYLIMRILPVIWSWSLVVTFFVMKMAKRLVSDSVEDWVVKTLVYISLHFFTVVFRRKGTTRSGHQSGVPVVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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