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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003911`

染色体: Chr05 坐标: 52835444-52839421 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003911`
名称	SmilChr05G003911
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	52835444 - 52839421 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024905`
GeneID	`131024905`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024905`
原始查询	`LOC131024905`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1
产物	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1
Arabidopsis	`AT5G25590` (AT5G25590) DNA ligase (DUF630 and DUF632) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832634] identity=68.8; qcov=0.643; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0394200` - identity=58.6; qcov=0.603; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04782 (DUF632); PF04783 (DUF630)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024905

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057810440.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057810440.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810440.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810440.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810440.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:52835694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:52835702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr5:52835715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr5:52835811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,D8
`Chr5:52835826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:52835859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B94,C40
`Chr5:52835901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:52836044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B122,B131,C22
`Chr5:52836045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B44,B48,C33
`Chr5:52836105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,C54,C77,D5
`Chr5:52836108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:52836345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810440.1

733 aa

366

733

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-59 aa PF04782 DUF632 291-596 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810440.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	59	1.1e-23	83.8	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057810440.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	291	596	7.6e-104	348.1	Protein of unknown function (DUF632)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954457.1
GCTAATTCAATCGACCGGATTCTTCTCCAAAAGCACTCAACTTCAGGAAAAGGAACCGGAGACAATCCGGCCCCTCTCTCTCTGTGCCGCTTTGTACGTCTCGGTGCAGTGTTGTCCCTCTGCAGAGAAATTTGTCCGTTTCTCCTTTTTCACCCTCAGCATTCATCATTCATGTCCACCGAAAAATAAAAAAGGAGAGATTTTAAATAAATTTCTGTTTATAGATACAGAGTTTTGTAGTGTAGATTTCGTGTGTGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024905
ATGGGGTGTGCGCAATCGAAAATAGACAATGAGGAATCGGTTTCTAGATGTAAGGAGAGGAGGAATTTGATGAAGGAGGCTGTTGTTGCGAGGAATGCTTTTGCATCGGCACATTCCGGCTACTCCGTCTCGCTTAAGGACACCGGCGCCGCACTGAGTGACTTCGCCGGCGGCGAGGTCCCTCCTCCGCCGCTGGAAACGGCGGCGCCGGCGGACCCTCCGGTTGCGGAGCGCCCCCCTCCGCCCCCTCCGTCGCCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810440.1
MGCAQSKIDNEESVSRCKERRNLMKEAVVARNAFASAHSGYSVSLKDTGAALSDFAGGEVPPPPLETAAPADPPVAERPPPPPPSPMESNLPPPPPPLPSFSPMSPLQRAVTMPAALSDSVRKGKMKGVAIHEGDIYEEDEEEEEEKEKEKGRFHRTKKGVDEAGVETPIRPPPNPATTPSEIRGMAWDYFFVDNMPSSNLDEVVEEGEGGYAEDMNGNLDQAFENVAGNDEFKTPEKQVGFEWIEAFKTPEETPASVPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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