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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003954`

染色体: Chr05 坐标: 53256496-53258716 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003954`
名称	SmilChr05G003954
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53256496 - 53258716 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024926`
GeneID	`131024926`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024926`
原始查询	`LOC131024926`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like
产物	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like
Arabidopsis	`AT4G11280` (ACS6) 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid (acc) synthase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826730] identity=63.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0578000` (ACS2) - identity=60; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006520 (amino acid metabolic process); GO:0008483 (transaminase activity); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024926

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810470.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810470.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810470.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810470.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810470.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53256820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A5,B71,C55
`Chr5:53257200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr5:53257208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr5:53257350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C77
`Chr5:53257378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:53257379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B24
`Chr5:53257424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr5:53257458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B104,B124,B20,C58
`Chr5:53257573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A5,B71,C55,D10
`Chr5:53257603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A5,B71,C55,D10
`Chr5:53257615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C35,C73
`Chr5:53257946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810470.1

489 aa

244

489

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 51-431 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810470.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	51	431	8.1e-105	351.7	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954487.1
TTCATTCTTCACTTCATCAACACACTACTCTCATAATTCAACATCTCCTCTAACTACAACTTCATTCATTTCCTTCATTTTTTGTGATTCTTTCATATCTTGTGCTACAAAGCAAAAAATGGAGTTCACCAAGGCAAGATCAAACCAAGGCCAAATTCTATCCAAGATTGCAACCAACGACGGGCATGGCGAAAACTCGCCTTACTTCGATGGCTGGAAGGCATACGACAGCGATCCTTACCATCCCACCAAAAACCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024926
ATGGAGTTCACCAAGGCAAGATCAAACCAAGGCCAAATTCTATCCAAGATTGCAACCAACGACGGGCATGGCGAAAACTCGCCTTACTTCGATGGCTGGAAGGCATACGACAGCGATCCTTACCATCCCACCAAAAACCCTCATGGAGTTATTCAAATGGGACTAGCAGAAAATCAGCTTTGCTTTGATCTAGTCCAAGAATGGATCAAAAACAACCCAAAGGCCTCCATTTGCACAGAAGAAGGCATTGCTGATTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810470.1
MEFTKARSNQGQILSKIATNDGHGENSPYFDGWKAYDSDPYHPTKNPHGVIQMGLAENQLCFDLVQEWIKNNPKASICTEEGIADFRDIAIYQDYHGLPQFRNAVARFMEKVRGNRVRFDPDRIVMSGGATGAQETLAFCLADRGDAFLVPTPYYPGNDRDLTWRTGVKLVPVVCESSDGFQITRRALESAYKEAQDSNVRVKGLLLNNPSNPLGTVLDRETLQESLNFTAEKNIHLICDEIYSATVFGQPGFVSVAELV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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