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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003848`

染色体: Chr05 坐标: 51960635-51963407 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003848`
名称	SmilChr05G003848
描述	uncharacterized SmilChr05G003848
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	51960635 - 51963407 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024934`
GeneID	`131024934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024934`
原始查询	`LOC131024934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Plant Tudor-like RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829379]; symbol=AT4G32440; hit=AT4G32440; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Plant Tudor-like RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829379]; symbol=AT4G32440; hit=AT4G32440; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G32440` (AT4G32440) Plant Tudor-like RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829379] identity=37.2; qcov=0.998; evalue=6.6e-69; confidence=medium
Rice	`Os02g0204500` (P0544H11.20-1) - identity=33.6; qcov=1.05; evalue=6.04e-55; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03735 (ENT); PF05641 (Agenet)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810478.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810478.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810478.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810478.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810478.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:51962441`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B127,C57,C71,C80
`Chr5:51962441`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B127,C57,C71,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810478.1

428 aa

214

428

Agenet

ENT

PF05641 Agenet 6-62 aa PF03735 ENT 363-418 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810478.1`	Pfam	`PF05641`	Agenet	Domain	6	62	4.1e-11	43.9	Agenet domain
`XP_057810478.1`	Pfam	`PF03735`	ENT	Domain	363	418	3.2e-13	50.2	ENT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954495.1
ACGCACACCCTACTTTTTTTCTGGTGTTGATTGAGTTTTGAGCCAACATTTTTATATTCCAATTCTACCCCCACCCCGAATATATATTTTCTTTCTTTATTATTTTATTTTATATATTTTCTTGCCCCAATTTGTTTCTTCAAAGCTCACGAAAACAAACCCTAGACCGTGAAACTGAGGAATAAGAATCTGTTTTTCAGAGAGCATCTGAGATTTGAACCCCTAATTCGGACTGCGGTGATCGTTTATACCTGTCTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024934
ATGAGATTCAAAACTGGGGACGTGGTTGAGGTGATGAAGAGTAGGGAGGTACCAGTTTCATGGCGTGCTGCTGACATACTATCACGTAGCGGGGATACTTATACCATCCAGTATGTTTGCTATCCTGGTATGGCAAATAAGCGGTTGGTGGAGGTGGTTTCAAGGAAGTTATTGAGACCTTGCCCTTCTTCGCTACAAGGGGCGAAGAGTTTCATAACAGGAGACATTGTTGAGGTCTTCCATCAATTTTCCTGGAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810478.1
MRFKTGDVVEVMKSREVPVSWRAADILSRSGDTYTIQYVCYPGMANKRLVEVVSRKLLRPCPSSLQGAKSFITGDIVEVFHQFSWKIAVVLNVLGGKKESRNNKIHHKVSTCKNRYLVRLLGCSKELAIDRTKIRMRQTWHDGKWVPLTKIPQVGDDVIVSKPSKSNCCPKMNFQVPVFDSRAKYQPAEDCGNIQDEAALRESAVISSRSLKRMSPYISSVVEANNGHVQKFRAAEKEGRKQRVVADRVLEKVHAVAYPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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