当前解析结果
SmilChr05G003932| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003932 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003932 |
| 描述 | protein SPIRAL1-like 5 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 53086270 - 53087226 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025004 |
|---|---|
| GeneID | 131025004 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025004 |
| 原始查询 | LOC131025004 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein SPIRAL1-like 5 |
| 产物 | protein SPIRAL1-like 5 |
| Arabidopsis | AT1G69230 (SP1L2)SPIRAL1-like2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843254] identity=48.1; qcov=1.1; evalue=1.16e-20; confidence=low |
| Rice | Os11g0629400- identity=69.4; qcov=0.375; evalue=2.43e-10; confidence=low |
| GO | GO:0010005 (cortical microtubule, transverse to long axis); GO:0043622 (cortical microtubule organization) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025004 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057810585.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057810585.1 |
| 3 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.40000 | XP_057810585.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057810585.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810585.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:53086529 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr5:53086582 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B63,B86,C29 |
Chr5:53086892 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B128 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。