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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003974`

染色体: Chr05 坐标: 53537027-53538178 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003974`
名称	SmilChr05G003974
描述	dehydration-responsive element-binding protein 1C-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53537027 - 53538178 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025044`
GeneID	`131025044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025044`
原始查询	`LOC131025044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dehydration-responsive element-binding protein 1C-like
产物	dehydration-responsive element-binding protein 1C-like
Arabidopsis	`AT4G25470` (CBF2) C-repeat/DRE binding factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828651] identity=51.9; qcov=1.1; evalue=1.04e-66; confidence=high
Rice	`Os04g0572400` (OsDREB1E) - identity=49; qcov=0.995; evalue=2.09e-46; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810619.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810619.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810619.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810619.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53537188`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	59	A20,A4,A9,B1,B100,B102,B117,B119,B126,B130,B15,B17,B18,B19,B2,B22,B23,B28,B30,B34,B36,B41,B46,B48,B5,B51,B54,B60,B63,B64,B66,B67,B74,B75,B86,B99,C17,C24,C29,C3,C34,C37,C38,C40,C44,C47,C54,C58,C6,C64,C66,C67,C7,C72,C84,C87,C9,D5,D9
`Chr5:53537296`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C35
`Chr5:53537296`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C35
`Chr5:53537429`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B49
`Chr5:53537429`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B49
`Chr5:53537437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr5:53537490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:53537555`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C74
`Chr5:53537555`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C74
`Chr5:53537558`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C74
`Chr5:53537558`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C74
`Chr5:53537569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810619.1

193 aa

193

AP2

PF00847 AP2 49-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810619.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	49	99	1.3e-15	58.1	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954636.1
TATAAAAAGAGCCAGAAAAAAAAGGCAAATACAATCTCCCGTCTTAGTATACACGCTAGCTATTTTGATACGTCTAGTTATATAATATAAGTGCAAACCAAGGGGGGAGAAAGTGGGAAGCCGATAAAAGTTGGGGGCAGATACGAAACTTCCGATGAAATTCTGGAAAGTTGAGTGAGCAGTGACCACTCTAAATCGTGACACGTGGACAAACAATAATGTCTCTTCAGTTTTATGTGCTGTAGGGGGCTGCTGCGTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025044
ATGTTTGGGAAAAACTATTCCGACGCTTTTTCCGGCGTGCCAGAGCTACCGGCAGCATCGGCCGGCGGTAACGAAGGGGTCATTCTAGCTTCCGCCAGCCCGAAGAAGCGGGGCGGGCGGAAGAAGGTCCGCGAGACGCGCCACCCGGTGTACCGCGGCGTCCGCCTGAGGAATTCCGGTAAGTGGGTTTGCGAGGTGAGAGTGCCCAACAACAAAACAAGGATCTGGCTGGGGACTTTCGCCACCGCAGAAATGGCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810619.1
MFGKNYSDAFSGVPELPAASAGGNEGVILASASPKKRGGRKKVRETRHPVYRGVRLRNSGKWVCEVRVPNNKTRIWLGTFATAEMAARAHDVAAIALRGRLACLNFADSTWRLPVPASCSAQDIQMAAAEAAETFSPESASLSMAEEEEAVFGRDNGLISDMCEGLMMSPPPPLYDYGVDVEADEIPLWSYSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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