当前解析结果
SmilChr05G003979| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003979 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003979 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003979 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 53573025 - 53576683 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025048 |
|---|---|
| GeneID | 131025048 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025048 |
| 原始查询 | LOC131025048 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025048 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057810626.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057810626.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057810624.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057810624.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810626.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:53575022 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr5:53575024 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr5:53575038 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr5:53575087 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B57 |
Chr5:53575951 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B29,B66,B74,B91,C16 |
Chr5:53575971 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C68 |
Chr5:53575971 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C68 |
Chr5:53575974 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr5:53576283 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A6,B110,B114 |
Chr5:53576288 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C64 |
Chr5:53576436 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B99,C64,C66 |
Chr5:53576438 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A14 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。