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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003993`

染色体: Chr05 坐标: 53763692-53767135 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003993`
名称	SmilChr05G003993
描述	protein FLX-like 3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53763692 - 53767135 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025061`
GeneID	`131025061`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025061`
原始查询	`LOC131025061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FLX-like 3
产物	protein FLX-like 3
Arabidopsis	`AT1G55170` (AT1G55170) DNA double-strand break repair protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841960] identity=39.9; qcov=1; evalue=1.3e-49; confidence=medium
Rice	`Os12g0193100` - identity=36.8; qcov=1.18; evalue=1.05e-50; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025061

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810633.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810633.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057810639.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810633.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810633.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53764053`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B130
`Chr5:53764053`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B130
`Chr5:53764919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:53765066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:53765082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:53765108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B94
`Chr5:53765120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2
`Chr5:53765212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D1
`Chr5:53765212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

12 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954662.1
AAATTCATCAATTAAAATCCTAACCAAAATATCACGGCCCCTACTCATATATTGTATAGTTTGCACCTCGATTCATGAAAATCCTACCACAACCAGAAAATGGATTATATAATAGCCCATATATTTTTAAGATTTTAACTTTAAAGCGATAGGCTAAAGCAAAAAAATTATTCTACTATCCATCTGATTAATATCTATCTTTTATACATTGTTGTGGGACTGTATAGAAGAAATTGAAATTGTGAATAAGAATTACCAAA...

XM_057954661.1
AAATTCATCAATTAAAATCCTAACCAAAATATCACGGCCCCTACTCATATATTGTATAGTTTGCACCTCGATTCATGAAAATCCTACCACAACCAGAAAATGGATTATATAATAGCCCATATATTTTTAAGATTTTAACTTTAAAGCGATAGGCTAAAGCAAAAAAATTATTCTACTATCCATCTGATTAATATCTATCTTTTATACATTGTTGTGGGACTGTATAGAAGAAATTGAAATTGTGAATAAGAATTACCAAA...

CDS

12 records

下载 CDS FASTA

LOC131025061
ATGGCTGGGAGAAATCGGATGCCCCGTCACCCTGATAGTTTCCGAGGTGCCCATGATGATCCACGTTCACTTCCACACCGGATGCCAATGCCGCTTCCTCCACATCCTGCGGCACTGGAAGAGGAACTTGAGCTCCAACACAGAGACATTCAAAGGCTCCTTGCTGAAAATAGACATGTCATTGATGACAATGTGATGCTTCAAAGGGACTTGACTTCGGTGAAAGATGAAATTCACAGATTGAATCAGGTCATTCCCAA...

Protein

12 records

下载 Protein FASTA

XP_057810633.1
MAGRNRMPRHPDSFRGAHDDPRSLPHRMPMPLPPHPAALEEELELQHRDIQRLLAENRHVIDDNVMLQRDLTSVKDEIHRLNQVIPKMHADKEAQRRELIERGMKLEAELRSVEPLRVEVVQLRTDAQKLSSQNKELSSQAQTMTKDITRLQSENKQVAAMKSDIDKMHKDLVDTRRVYEYEKKGNEELVEQNRAMEKNLIAMAREIEKLRAEQASADRRGKGAGGYGLLNGSPETRYPGPYGDVYGPGPWGSFDKRSGP...

XP_057810634.1
MAGRNRMPRHPDSFRGAHDDPRSLPHRMPMPLPPHPAALEEELELQHRDIQRLLAENRHVIDDNVMLQRDLTSVKDEIHRLNQVIPKMHADKEAQRRELIERGMKLEAELRSVEPLRVEVVQLRTDAQKLSSQNKELSSQAQTMTKDITRLQSENKQVAAMKSDIDKMHKDLVDTRRVYEYEKKGNEELVEQNRAMEKNLIAMAREIEKLRAEQASADRRGKGAGGYGLLNGSPETRYPGPYGDVYGPGPWGSFDKRSGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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