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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003996`

染色体: Chr05 坐标: 53807490-53814420 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003996`
名称	SmilChr05G003996
描述	LOB domain-containing protein 40-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53807490 - 53814420 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025064`
GeneID	`131025064`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025064`
原始查询	`LOC131025064`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 40-like
产物	LOB domain-containing protein 40-like
Arabidopsis	`AT1G68510` (LBD42) LOB domain-containing protein 42 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843180] identity=47.7; qcov=1.09; evalue=2.8e-58; confidence=high
Rice	`Os01g0511000` - identity=72.6; qcov=0.484; evalue=1e-55; confidence=medium
GO	GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025064

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810647.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810647.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810647.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810647.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810647.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53807862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B3,D10
`Chr5:53807882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B136
`Chr5:53807964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:53807991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,D10,D11
`Chr5:53813807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A16,B103,B139,C4
`Chr5:53813813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:53813907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C64,C66
`Chr5:53814165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810647.1

219 aa

110

219

LOB

PF03195 LOB 4-101 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810647.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	4	101	2.2e-22	80.2	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954664.1
ATAATTCATTTCATACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGAAGATGGGAATAAGCTGCAATGGCTGCCGAGTTCTCCGCAAAGGCTGCAGCGAAGATTGCAGTCTAAAACCTTGTCTCGAGTGGCTTAACTCACCCCAATCTCAAGCCAACGCCACCTTGTTTCTCGCCAAATTCTACGGCCGCGCCGGCCTCCTCAACCTCATCGCCGCCGCCCCTTCTCATCGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025064
ATGGGAATAAGCTGCAATGGCTGCCGAGTTCTCCGCAAAGGCTGCAGCGAAGATTGCAGTCTAAAACCTTGTCTCGAGTGGCTTAACTCACCCCAATCTCAAGCCAACGCCACCTTGTTTCTCGCCAAATTCTACGGCCGCGCCGGCCTCCTCAACCTCATCGCCGCCGCCCCTTCTCATCGCCGCCCCGAAATTTTTAGGTCACTCCTCTACGAAGCCTGTGGACGGATCATCAACCCCGTCCACGGCTCCGTCGGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810647.1
MGISCNGCRVLRKGCSEDCSLKPCLEWLNSPQSQANATLFLAKFYGRAGLLNLIAAAPSHRRPEIFRSLLYEACGRIINPVHGSVGLMSSGDWPRCHAAVEAVLGGVHLVSPCDIRHAPKGRDRRKRSTSSAAAESEAKFTITGWDHNKDLLVIDEKSGRAPSHDSFSTETVEPSLVSFDDQGTIPEPRLSEVGLELTLGLNPVLHTYLSAVIHISDSQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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