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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004005`

染色体: Chr05 坐标: 53983577-53985283 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004005`
名称	SmilChr05G004005
描述	adenylate isopentenyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	53983577 - 53985283 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025073`
GeneID	`131025073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025073`
原始查询	`LOC131025073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate isopentenyltransferase-like
产物	adenylate isopentenyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G68460` (IPT1) isopentenyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843175] identity=48.9; qcov=0.945; evalue=5.38e-96; confidence=high
Rice	`Os01g0688300` (OsIPT8) - identity=47; qcov=0.848; evalue=2.62e-61; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006400 (tRNA modification); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0009824 (AMP dimethylallyltransferase activity); GO:0052381 (tRNA dimethylallyltransferase activity)
KEGG	smil00908 (Zeatin biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01715 (IPPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057810658.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057810658.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810658.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810658.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810658.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:53984069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B21,B62,B88,C50
`Chr5:53984209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr5:53984229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr5:53984267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,B8,C3,C30,D2
`Chr5:53984270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B63
`Chr5:53984306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B47,B89
`Chr5:53984320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B105,B106
`Chr5:53984321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr5:53984325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:53984332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr5:53984336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr5:53984341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B34,B86,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810658.1

329 aa

164

329

IPPT

PF01715 IPPT 73-151 aa PF01715 IPPT 170-274 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810658.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	73	151	1e-28	101.3	IPP transferase
`XP_057810658.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	170	274	1e-28	101.3	IPP transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954675.1
GCTATCAAATCCTTTTACTGCAGCAGATTTGGTGGGAACTGTATAATTTTTTTCCATTCTACACATATTTTCACTCATAATCTCCCTTTAGCAAACCATATAGAGTATATCCTTAATTATTACTACCTCTTTAGCATGCATATGAATAAAAACCGGCGCATCTCTGCGTGAATAAATGATTGAATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAAGAAAATAAGCGACACACACACATATATATGTGTTCATCACTTCCAAGAGGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025073
ATGAGAAGATTATCACTGCTCCAATTCCAAACGCGTCATCACGGAACACCACCGTTTCGCAGGTGCGCCGCGAAGATGGCCTCCGCCGCCGCCTCCCGCCGCCACAGGAAGATCGTGGTCGTGATGGGCCCCACGGGCTGCGGCAAGACCAAGCTCTCCATCGACCTGGCGTCGAGATTCTTCCGTTCGTCGGAGATCGTCAACTCCGACAAAATCCAAATCCACCGCGGCCTCGACATCACCACCAACAAGATCCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810658.1
MRRLSLLQFQTRHHGTPPFRRCAAKMASAAASRRHRKIVVVMGPTGCGKTKLSIDLASRFFRSSEIVNSDKIQIHRGLDITTNKIPPRDRENVPHHLLGEFDSSESHPEFTPSDFRLAASLLISRIHSRRNTPFVVGGSNSFIYALLAEKFDPESDAFAGPDSGVCRGLRYSCCFIWVDVSPAVLAEHLVRRVDDMLGSGMFEELAEYFGGGEWDSVSRRGLRGAIGVPEFRKYFERKARGDWTAGDDVAERGAYEEAVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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