当前解析结果
SmilChr05G004023| 统一新 Gene ID | SmilChr05G004023 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G004023 |
| 描述 | non-specific lipid-transfer protein 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 54215071 - 54215709 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025088 |
|---|---|
| GeneID | 131025088 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025088 |
| 原始查询 | LOC131025088 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | non-specific lipid-transfer protein 2-like |
| 产物 | non-specific lipid-transfer protein 2-like |
| Arabidopsis | AT3G18280 (AT3G18280)Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821356] identity=48.5; qcov=1.05; evalue=3.55e-31; confidence=medium |
| Rice | Os05g0550300 (OsLTP2.4)- identity=54.5; qcov=0.688; evalue=9.64e-25; confidence=medium |
| GO | GO:0006869 (lipid transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025088 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057810676.1 |
| 2 | Cell wall | 细胞壁 | 0.20000 | XP_057810676.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057810676.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810676.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810676.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:54215499 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B65,B78,D6 |
Chr5:54215583 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr5:54215607 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 88 | A1,A11,A15,A16,A23,A25,A3,A5,A8,A9,B10,B106,B110,B112,B118,B119,B12,B123,B125,B13,B131,B132,B134,B135,B138,B139,B18,B19,B2,B21,B22,B25,B31,B33,B34,B4,B42,B43,B45,B51,B52,B53,B55,B58,B68,B74,B76,B79,B81,B83,B86,B87,B90,B92,B95,C10,C13,C15,C16,C18,C21,C22,C23,C27,C29,C3,C30,C34,C39,C41,C42,C45,C48,C49,C50,C52,C54,C64,C66,C7,C75,C79,C81,C84,C86,D10,D6,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。