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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004037`

染色体: Chr05 坐标: 54340304-54344851 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004037`
名称	SmilChr05G004037
描述	elongator complex protein 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54340304 - 54344851 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025099`
GeneID	`131025099`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025099`
原始查询	`LOC131025099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elongator complex protein 2
产物	elongator complex protein 2
Arabidopsis	`AT1G49540` (ELP2) elongator protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841378] identity=67.8; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0493900` (OsWD40-161) - identity=62.2; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0002098 (tRNA wobble uridine modification); GO:0005515 (protein binding); GO:0033588 (elongator holoenzyme complex)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025099

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810688.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057810688.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057810688.1`
4	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057810688.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54340411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B69,B9
`Chr5:54340442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C82,D7
`Chr5:54340651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:54341236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:54341864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr5:54341967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B69,B9
`Chr5:54342066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,D5
`Chr5:54343931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:54343969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,D5
`Chr5:54343978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B15,B68,D1
`Chr5:54344230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B44,B55,C18,D8
`Chr5:54344387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B128,B52,B69,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810688.1

835 aa

418

835

WD40

PF00400 WD40 54-100 aa PF00400 WD40 113-150 aa PF00400 WD40 219-258 aa PF00400 WD40 300-343 aa PF00400 WD40 402-439 aa PF00400 WD40 632-667 aa PF00400 WD40 685-717 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810688.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	54	100	4.1e-47	157.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057810688.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	113	150	4.1e-47	157.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057810688.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	219	258	4.1e-47	157.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057810688.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	300	343	4.1e-47	157.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057810688.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	402	439	4.1e-47	157.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057810688.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	632	667	4.1e-47	157.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057810688.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	685	717	4.1e-47	157.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954705.1
CCTCTTATTCCGTCGACTGCAAAACCCCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACAGACGACACATACACACATGCGAGTTAATGGGCGCTGAAGTTGGAGAAATGGCAGTGGAAGTGGAGAGAGCTTTCATAGGAGCTGGCTGCAACAGAATAGTTCACAACGTTTCGTGGGGCGCCTGTGATTTGATCTCGTTTGGCGCCCAAAATGCCGTTGCCATATTTTGCCCCAAGACTGCGCAAATTTTGACTACGCTTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025099
ATGGGCGCTGAAGTTGGAGAAATGGCAGTGGAAGTGGAGAGAGCTTTCATAGGAGCTGGCTGCAACAGAATAGTTCACAACGTTTCGTGGGGCGCCTGTGATTTGATCTCGTTTGGCGCCCAAAATGCCGTTGCCATATTTTGCCCCAAGACTGCGCAAATTTTGACTACGCTTCCGGGCCACAAAGCCTATGTGAACTGCACGCATTGGTTGCCCAGCAGCAAGTTTGCATTTAAAGCGAAGAATTTGGAAAGCCATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810688.1
MGAEVGEMAVEVERAFIGAGCNRIVHNVSWGACDLISFGAQNAVAIFCPKTAQILTTLPGHKAYVNCTHWLPSSKFAFKAKNLESHYLLSGDADGAILLWELSLANKKWRNVLQVPEKHKKGVTCISAIVMSQTDALFASSSSDGVVSIWEIIFPSSAGGECKLSCLDSIVACKKPMVALSFVELPGKGGHLALAMGGLDNKIHIYSGERSGKSVRACELKGHTDWIRCLDFSLPTYENGETSILLVSSSQDKGIRIWKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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