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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004052`

染色体: Chr05 坐标: 54494918-54498456 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004052`
名称	SmilChr05G004052
描述	sec-independent protein translocase protein TATC, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54494918 - 54498456 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025115`
GeneID	`131025115`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025115`
原始查询	`LOC131025115`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sec-independent protein translocase protein TATC, chloroplastic
产物	sec-independent protein translocase protein TATC%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G01110` (APG2) Sec-independent periplasmic protein translocase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814640] identity=66.7; qcov=0.971; evalue=2.07e-146; confidence=high
Rice	`Os01g0501700` (OsTATC) - identity=75.8; qcov=0.824; evalue=1.32e-134; confidence=high
GO	GO:0009977 (proton motive force dependent protein transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0033281 (TAT protein transport complex); GO:0043953 (protein transport by the Tat complex); GO:0065002 (intracellular protein transmembrane transport)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00902 (TatC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025115

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810713.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057810713.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057810713.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057810713.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810713.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54495121`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A20,B10,B107,B11,B113,B114,B123,B13,B134,B27,B30,B32,B42,B53,B63,B67,B8,B86,C10,C26,C38,C44,C58,C87,D11,D2,D6,D8
`Chr5:54495130`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr5:54495130`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B8
`Chr5:54495135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr5:54495147`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B68
`Chr5:54495147`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B68
`Chr5:54495151`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B68
`Chr5:54495151`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B68
`Chr5:54495164`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	51	A14,A19,A20,A24,A3,A6,B10,B107,B11,B113,B114,B119,B123,B125,B131,B133,B135,B20,B30,B32,B34,B35,B42,B53,B68,B75,B79,B8,B81,B86,C18,C26,C28,C33,C35,C38,C44,C48,C51,C58,C61,C66,C69,C72,C87,C9,D10,D11,D2,D7,D8
`Chr5:54495212`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B125,B38,B39,B48,B52,C20
`Chr5:54495213`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	73	A11,A14,A15,A19,A2,A20,A21,A24,A3,A4,B10,B102,B104,B107,B11,B113,B114,B115,B119,B12,B123,B131,B137,B14,B140,B20,B22,B30,B32,B35,B40,B42,B53,B59,B62,B68,B71,B75,B78,B81,B84,B86,B91,B96,B99,C11,C12,C18,C23,C26,C28,C29,C31,C33,C35,C38,C48,C49,C51,C58,C6,C61,C65,C66,C69,C72,C73,C78,C86,C9,D2,D7,D8
`Chr5:54495217`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	80	A1,A11,A14,A15,A19,A2,A20,A21,A3,B10,B103,B104,B105,B107,B11,B115,B123,B125,B131,B137,B14,B20,B22,B23,B32,B35,B36,B38,B39,B40,B42,B45,B48,B52,B59,B62,B63,B68,B71,B73,B75,B78,B86,B90,B91,B92,B96,B99,C1,C11,C12,C14,C18,C20,C23,C26,C31,C33,C35,C36,C38,C49,C51,C58,C6,C61,C62,C65,C66,C69,C72,C73,C78,C81,C82,C86,C9,D2,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810713.1

346 aa

173

346

TatC

PF00902 TatC 121-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810713.1`	Pfam	`PF00902`	TatC	Family	121	329	2.1e-66	224.4	Sec-independent protein translocase protein (TatC)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954730.1
ATATTATTCATTTAATTCCCCACGCTACCGGCGGCGCACGATAGAACATCCCGTAGCCATTCTCCACTACAATGCGCCGGGCTTCGCTCCCAAAATATCGCCCATCACGCTCAATTCCTCAACAAAAACCATCAATAAATTGAGTTGCTAAGCACAGCAAAGTCGGCGAGATCTTCACACACTAACAGCAAAACCAGCAATGGGAGCTACAGGAGCTGCCGTCTACGGCGCGCACCTCAAGAGTAACACCCTATGTTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025115
ATGGGAGCTACAGGAGCTGCCGTCTACGGCGCGCACCTCAAGAGTAACACCCTATGTTTCAATTGCTCGAGTTCAAATCCCCCACCGAGAGCGCTCCATCGCATTGATCAGAGGAAGCCCATGTTGCTAGCCTTCTCGAATAGGAAAAGTTTGAAGAAATTTAGCAGAATCGCTTGCTCAGCTATCGAAGATGTCACGAAGAAGCAGCTGGAAGTCGGCGGCGGCAGCTTGAATGTCGCTGCTGAAGATAGACCCGAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810713.1
MGATGAAVYGAHLKSNTLCFNCSSSNPPPRALHRIDQRKPMLLAFSNRKSLKKFSRIACSAIEDVTKKQLEVGGGSLNVAAEDRPESSVNNESEDGGNFIYNFLYPSKELLPDDKEMSIYDHLEELRTRLFVSVVAVGAAMVGCFAFSKELIMFLEKPVSEQGVRFLQLAPGEFFFTSLKVSGYCSLLVGSPIILYEIIAFILPGLTKDERRFLGPIVLGSSILFYIGIAFSYYVLTPAALTFFVSYAEGVVESLWSIDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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