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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004054`

染色体: Chr05 坐标: 54500925-54502974 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004054`
名称	SmilChr05G004054
描述	probable histone chaperone ASF1A
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54500925 - 54502974 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025116`
GeneID	`131025116`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025116`
原始查询	`LOC131025116`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable histone chaperone ASF1A
产物	probable histone chaperone ASF1A
Arabidopsis	`AT1G66740` (SGA2) ASF1 like histone chaperone [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842992] identity=80.8; qcov=0.941; evalue=1.23e-100; confidence=high
Rice	`Os05g0553800` - identity=74.5; qcov=1; evalue=8.07e-98; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006335 (DNA replication-dependent chromatin assembly); GO:0042393 (histone binding)
KEGG	-
Pfam	PF04729 (ASF1_hist_chap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025116

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810714.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810714.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057810714.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810714.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54501745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B140,C82,D7
`Chr5:54502627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:54502644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810714.1

188 aa

188

ASF1_hist_chap

PF04729 ASF1_hist_chap 1-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810714.1`	Pfam	`PF04729`	ASF1_hist_chap	Family	1	153	1e-72	243.8	ASF1 like histone chaperone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954731.1
TGCCAAATTTATTTATTTTTTTCGTTTTTCTTTATTTTTTTTTGGATCCGTTGGCAGATGAAGTAAAAAAATTATTGCTCGATTTGATTTTCGCGGTTGCCCATTTTGTCGCTTAAAAATTTTCCCGCCAAACCACGAATTCTCTGCCTTTTGTGTATAAAGTGTTGAATTCTGCTCACTATCTCTGCCGCTTAGATTTCGTTCAGTTTTCAATTTCTAGGGTTCTGTATCAGCGTTTCTCCCCCAATTCGCGAGGTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025116
ATGAGCGCCGTCAACTTGAAAGATGTCACCGTTTTGGGCAATCCGGCTCCATTCGTCGATCCCTTCCAATTCGAGATTTCGTACGAATGTTTAACTCCCCTCGAAGACGATCTGGAGTGGAAACTCATCTATGTTGGATCAGCTGAGGATGAAACATACGACCAAGTACTAGAAAGCGTGCTTGTCGGGCCTGTTAATGTTGGCAACTACCGTTTTGTTTTTCAGGCTGATCCACCAGACCCATCAAAAATTCAAGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810714.1
MSAVNLKDVTVLGNPAPFVDPFQFEISYECLTPLEDDLEWKLIYVGSAEDETYDQVLESVLVGPVNVGNYRFVFQADPPDPSKIQEEDIIGVTVLLLTCSYQGQEFVRVGYYVNNDYEDEQLKAEPPQKVLIDKVQRNILADKPRVTKFPINFCPEKNENEEQQPCASPEASKQGDEPLSNQSSIECS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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