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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004059`

染色体: Chr05 坐标: 54543542-54546931 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004059`
名称	SmilChr05G004059
描述	uncharacterized SmilChr05G004059
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54543542 - 54546931 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025122`
GeneID	`131025122`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025122`
原始查询	`LOC131025122`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288]; symbol=AT2G07190; hit=AT2G07190; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G07190` (AT2G07190) transmembrane protein, putative (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815288] identity=28.9; qcov=0.145; evalue=3.9e-09; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016926 (protein desumoylation); GO:0016929 (deSUMOylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025122

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810722.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810722.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810722.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057810722.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057810722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54543684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C35,C4,C76,D11
`Chr5:54544121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B45,C5,C64,C66
`Chr5:54544149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr5:54544166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B89,C27
`Chr5:54544168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B49,C3
`Chr5:54544189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:54544316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr5:54544345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,D7
`Chr5:54544395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C52
`Chr5:54544413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr5:54544443`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A19,B10,B111,B136,B137,B85,B88,C12,C14,C24,C33,C35,C6,C61,C7,C79,C86,D3,D6
`Chr5:54544464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,C55,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810722.1

788 aa

394

788

DUF8566

DUF1985

Peptidase_C48

PF29561 DUF8566 35-244 aa PF09331 DUF1985 87-213 aa PF02902 Peptidase_C48 662-764 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810722.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	35	244	2.1e-12	48.0	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057810722.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	87	213	3.1e-12	47.4	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057810722.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	662	764	2.6e-11	44.5	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954739.1
TCGTGGCAGATTAAAATGTTGACACGTCGCCTATATGAACTAGCAACATTGTGAGGTAGGTAGGTAGATGTTGTAAGTTGTCGTTAGAACATTTGACACCGTCGATTACCAAGTTTTTTGAACGACGGACATCTGTGATGCCGGAACCTGCATCGATGAGCCAAATGGTAGAGGAGGCACCATCGACGGAACTATCAAGACCCACCCCTCCAGGTGTGAAATTGAGAGCTAGAGGGCAAATGTGGTATTTGCATGACATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025122
ATGCCGGAACCTGCATCGATGAGCCAAATGGTAGAGGAGGCACCATCGACGGAACTATCAAGACCCACCCCTCCAGGTGTGAAATTGAGAGCTAGAGGGCAAATGTGGTATTTGCATGACATTATGGAGCAATTATCTGTATCAAAATTTTGTATCCTTCGGAATTCATGCTTCGCCAAGTTGTTTGAGATTGGTGAGATGCACTTCCAAGGTGAATTGGTGAATTTATTATGTAGGAGGCTACATTCGAGTAGCTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810722.1
MPEPASMSQMVEEAPSTELSRPTPPGVKLRARGQMWYLHDIMEQLSVSKFCILRNSCFAKLFEIGEMHFQGELVNLLCRRLHSSSLDRKTLLFNFSDHLVEFGPADFCAMTGLKFGGSRKLPKNSKFHGEVFSCRNDMFFADIETKFRNKCLTTEGNSVRSVKLAYLLIVYGLLVMNDPSNGKLDLGYMHLVDNMDNFHDFPWGLVAYEYLMAATHRLKTEMLAAENEKSKITLEVSGFIYVLQCWCFEVIPTLGTFCAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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