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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004068`

染色体: Chr05 坐标: 54592630-54594370 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004068`
名称	SmilChr05G004068
描述	uncharacterized SmilChr05G004068
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54592630 - 54594370 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025130`
GeneID	`131025130`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025130`
原始查询	`LOC131025130`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox489; symbol=OsFbox489; hit=Os09g0448100; species=rice; confidence=low
产物	OsFbox489; symbol=OsFbox489; hit=Os09g0448100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0448100` (OsFbox489) - identity=27.6; qcov=0.398; evalue=8.56e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025130

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810731.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057810731.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810731.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810731.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810731.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54592861`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A16,B103,B139,B74,C4,C7
`Chr5:54592913`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B16,C16,C29,C32
`Chr5:54592913`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B16,C16,C29,C32
`Chr5:54592915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr5:54592929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C70
`Chr5:54592938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C29,C32
`Chr5:54592960`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A2,A24,A25,B43,B69,B96
`Chr5:54592965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C83
`Chr5:54593025`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B50,C32
`Chr5:54593025`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B50,C32
`Chr5:54593028`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C32
`Chr5:54593028`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810731.1

392 aa

196

392

FBA_1

FBA_3

PF07734 FBA_1 47-204 aa PF08268 FBA_3 48-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810731.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	47	204	4.4e-13	49.6	F-box associated beta propeller domain
`XP_057810731.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	48	303	3.3e-18	66.5	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954748.1
TACAGTTTCCGTTTCCGTTTCTGTTTCAGCTGTGTGTCATTTAATTTGATGGTGGGTTTGTTTCAAGCTTAAGAGTTCACCTATTTTTGCGTCGACTTTGTACGGTCGTTTGAAGGTTTGTGGATTTTTAGGATTTCATGTCACAAATTCCTATTCAATTTTGTTTTGCAGTATGGAGGGCCTTTTTCTGAAACGCTATCACACCGCTAGTTGTAATAGGAATTACTTATCGTTACTTTCTGTTTCTGGGGAAGACTGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025130
ATGGAGGGCCTTTTTCTGAAACGCTATCACACCGCTAGTTGTAATAGGAATTACTTATCGTTACTTTCTGTTTCTGGGGAAGACTGGTCTGTGTGTGAAAATGATGAACCTATCATGCTTCCTTTCGCTAGAAATTCTATTATTGATGGTAGTAGTTGTGGTGGGTTGATGTATTTTGACAACTTTAGGGGTAGGATTATAATTTGCAATCCAACTACCAAAACTTTCGAACCCCTTGATCCGCCCAAGTTCCCACGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810731.1
MEGLFLKRYHTASCNRNYLSLLSVSGEDWSVCENDEPIMLPFARNSIIDGSSCGGLMYFDNFRGRIIICNPTTKTFEPLDPPKFPRPPIMIIFCGSGFGYDPISDDYKVVRHYYHSYFSCIKNSGRDPKHVVEVFSLKHGFWKEIQGPVVDDDDGRCLVSTTCMTGIYVDGVCYWTSCICVISFDCTDERFSSFDLPMKKNQDGDFLHYLIKVNGVLGVFRYERPPPFGPEYVEFSTTFELLVREESSWVPWCNVDLSNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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