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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004070`

染色体: Chr05 坐标: 54601998-54605370 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004070`
名称	SmilChr05G004070
描述	DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH15 chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54601998 - 54605370 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025132`
GeneID	`131025132`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025132`
原始查询	`LOC131025132`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH15 chloroplastic-like
产物	DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH15 chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G70070` (EMB25) DEAD/DEAH box helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843343] identity=81; qcov=0.725; evalue=7.09e-51; confidence=high
Rice	`Os02g0739000` - identity=87.4; qcov=0.688; evalue=2.12e-51; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0035673 (oligopeptide transmembrane transporter activity); GO:0055087 (Ski complex); GO:0070478 (nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF03169 (OPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025132

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810732.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057810732.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810732.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057810733.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810732.1

186 aa

186

DEAD

OPT

PF00270 DEAD 2-50 aa PF03169 OPT 137-171 aa

XP_057810733.1

172 aa

172

DEAD

OPT

PF00270 DEAD 2-50 aa PF03169 OPT 137-171 aa

XP_057810734.1

138 aa

138

DEAD

PF00270 DEAD 2-50 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810732.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	2	50	1.6e-07	31.9	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057810732.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	137	171	2.1e-07	30.7	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057810733.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	2	50	1.4e-07	32.1	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057810733.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	137	171	2.8e-07	30.3	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057810734.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	2	50	8.7e-08	32.8	DEAD/DEAH box helicase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954751.1
TTGAAGTCTCACCCACCACTCTCTCTCTCTCTCTCGCCGTACTTCTATCTTCTTCTTCTCTCTGCCACCGCCTTACTCCCTTCAAACCCGGCGGCTACTGTCGCCGCCAGCCACCACTGCCACGGTATCCCCTTTGTAGGCCTCGCATCTGCCTGCCTCTCGTTCCCTCTCTAAATCATGAAAAATCCCCAAAAATCCCTAGCTTTCTTCCCTTTCAATTTCCGACGAGATTACCGCCTGAACCACCCTCTTCTTCTTCA...

XM_057954749.1
TTGAAGTCTCACCCACCACTCTCTCTCTCTCTCTCGCCGTACTTCTATCTTCTTCTTCTCTCTGCCACCGCCTTACTCCCTTCAAACCCGGCGGCTACTGTCGCCGCCAGCCACCACTGCCACGGTATCCCCTTTGTAGGCCTCGCATCTGCCTGCCTCTCGTTCCCTCTCTAAATCATGAAAAATCCCCAAAAATCCCTAGCTTTCTTCCCTTTCAATTTCCGACGAGATTACCGCCTGAACCACCCTCTTCTTCTTCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131025132
ATGCTTTCCGATGTGGATGTGATTGTTTTGGATGAAGTGCATTATTTGAGCGATATATCCAGGGGTACAGTTTGGGAGGAGATTGTAATTTACTGCCCTAAACAAGTGCAATTAATCTATCTTTCTGCCACTGTCGCAAACCCAGATGAGTTGGCGGGTTGGATTGGTCAGATTCATGGAAAAACTGAGTTGGTAACATCATCTAAGCGTCCAGTTCCGTTGACTTGGCACTTCTCAACAAAGACAGCATTGTTACCACT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057810732.1
MLSDVDVIVLDEVHYLSDISRGTVWEEIVIYCPKQVQLIYLSATVANPDELAGWIGQIHGKTELVTSSKRPVPLTWHFSTKTALLPLLDQKGTGMNSVAASYLNDTPALKKADIGSAVPFQIVVRLFVGNSRTPHTMVGYGWAGMLRKYLVDPVDMWWPSNVTQVSLFRSSRWESMSYEDYYKREG

XP_057810733.1
MLSDVDVIVLDEVHYLSDISRGTVWEEIVIYCPKQVQLIYLSATVANPDELAGWIGQIHGKTELVTSSKRPVPLTWHFSTKTALLPLLDQKGTGMNSVAASYLNDTPALKKADIGSAVPFQIVVRLFVGNSRTPHTMVGYGWAGMLRKYLVDPVDMWWPSNVTQVSLFSSLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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