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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004087`

染色体: Chr05 坐标: 54722720-54724723 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004087`
名称	SmilChr05G004087
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54722720 - 54724723 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025148`
GeneID	`131025148`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025148`
原始查询	`LOC131025148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 2-like
产物	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 2-like
Arabidopsis	`AT1G18650` (PDCB3) plasmodesmata callose-binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838446] identity=51.8; qcov=0.647; evalue=4.62e-35; confidence=medium
Rice	`Os03g0756300` (OSJNBb0081K01.7) - identity=40.8; qcov=1.01; evalue=7.36e-34; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025148

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057810754.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057810754.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810754.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810754.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54723064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:54723068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:54723084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C48
`Chr5:54724394`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr5:54724394`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810754.1

173 aa

173

PF07983 X8 22-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810754.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	22	92	6.5e-21	75.5	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954771.1
CTGAAGTGAAAAATTAATGACATTGTGACCGATTGAAGTAGCGTCGAACTACGTTGTTTAGTACATCGATCATTTTATTCATGTAAAGAAGTGCACCTTGAGGAAAATTTGACAATTTTGAAAATCAAAACAAATAAAAGTTTGTCTATTTGTAATCATATTTTTTAGTTTATGTCCAAATTTTATAACTATATATATATATATATATATATAGGTATAATACACACCCCACAGTGTCTCTCTCTCTCTCCTCATTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025148
ATGGCTGCTTTGGTGTTGGGCTTTGTGATTTACTTAGCCTTGGCTGCTCCTTCAGATGCAGCCTACTGCCTGTGCAACGCAGGGGTGAGCGACGCCGTTTTGCAGAAGAACATCGATTACGCGTGCGGAAACGGAGCAGATTGCTCAGCAATCCTCCAAAATGGGGCGTGTTTCAATCCAAACACCGTCAAAGATCACTGCAATTACGCCGTCAATAGCTATTATCAGAGGAGATCCCAAAACGGTGGAAGCTGTGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810754.1
MAALVLGFVIYLALAAPSDAAYCLCNAGVSDAVLQKNIDYACGNGADCSAILQNGACFNPNTVKDHCNYAVNSYYQRRSQNGGSCDFQGSASVSQTGPTGVASACVYQASPSTGGGTTTPTSGGGATTIPGGSFGPTGSTGFGTTDNGASVTLSSLAMLVVSLFLSLVISRFI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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