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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004100`

染色体: Chr05 坐标: 54851346-54857304 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004100`
名称	SmilChr05G004100
描述	uncharacterized SmilChr05G004100
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54851346 - 54857304 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025161`
GeneID	`131025161`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025161`
原始查询	`LOC131025161`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	appr-1-p processing enzyme family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843266]; symbol=AT1G69340; hit=AT1G69340; species=arabidopsis; confidence=high
产物	appr-1-p processing enzyme family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843266]; symbol=AT1G69340; hit=AT1G69340; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G69340` (AT1G69340) appr-1-p processing enzyme family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843266] identity=81; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0444400` - identity=76.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01661 (Macro); PF13716 (CRAL_TRIO_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025161

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057810774.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057810774.1`
3	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057810774.1`
4	Cell projection	细胞突起	0.40000	`XP_057810774.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057810774.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54852041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr5:54852255`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A5,B23,B53,C13
`Chr5:54852255`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A5,B23,B53,C13
`Chr5:54853552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr5:54854015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B37
`Chr5:54854722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B5,C33
`Chr5:54855118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:54855164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr5:54855346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr5:54856574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B140,B38,B39,C12
`Chr5:54856613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B93,C82,D1,D7
`Chr5:54856638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B14,B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810774.1

559 aa

280

559

Macro

CRAL_TRIO_2

PF01661 Macro 98-210 aa PF13716 CRAL_TRIO_2 406-537 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810774.1`	Pfam	`PF01661`	Macro	Domain	98	210	4e-30	104.9	Macro domain
`XP_057810774.1`	Pfam	`PF13716`	CRAL_TRIO_2	Domain	406	537	7.2e-34	117.8	Divergent CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954791.1
AAATATAAATAAAAAATCAGAAATTCCACCGCAGACTCAAACTCAGACTTGAACCCCGTTGATCGTCTGCCTCAAATTCCATCTAATCATTAGGTCAAGCTTCAAATTTTCTCCGTTGATTCTCAAATCGCACACCAGCTCAAATTATACGTATTTTGAGTGGTAGTGGGAGGGTAGAGGAGGTGAAGATTTGATCTGGGACCGTACATTATGTATCGGTCTGGGGCCGCAACCACTAACCGAGGTGGGGTGCCAACGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025161
ATGTATCGGTCTGGGGCCGCAACCACTAACCGAGGTGGGGTGCCAACGGATAGTGGGGACTCTGTTGTGACCCTAGATCAAGTCCCGTGTTGGAGCGATTCAGACTTTAGATACTCGTATGAGAACGAAGATTCAGGTTCGAATCTGCATTTTCCAGACCCATTGACCGCAGCATCTGAAGGAGAGAATAGTGGAAATGGAATGGCATCCAAGTTTCCCATGGATCGTGAAATTAACTCGAAGATATATCTTTGGAGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810774.1
MYRSGAATTNRGGVPTDSGDSVVTLDQVPCWSDSDFRYSYENEDSGSNLHFPDPLTAASEGENSGNGMASKFPMDREINSKIYLWRGNPWNLEVDAVVNSTNENLDEAHSSPGLHAAAGPGLAEECSTLGGCRTGMAKVTNAYDLPARRVIHTVGPKYAVKYHTAAENALSHCYRSCLELLIDNGLHSIAMGCIYTEAKNYPREPAAHVAIRTVRRFLEKQKDKIHAIVFCTTTSSDTEIYKRLLPLYFPRDKLEEEIAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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